Diferencia entre AFLP y RFLP

Diferencia de clave: AFLP vs RFLP
 

Los estudios de ADN tienen una importancia inmensa para comprender y determinar las relaciones filogenéticas, diagnosticar enfermedades genéticas y mapear los genomas del organismo. Varias técnicas asociadas con el análisis de ADN también se utilizan para la identificación de un gen en particular o una secuencia de ADN en un conjunto de ADN desconocido. Se conocen como marcadores moleculares. Polimorfismo de longitud de fragmento amplificado (AFLP) y Polimorfismo de longitud de fragmento de restricción (RFLP) son dos de estos marcadores moleculares (métodos) desarrollados en biología molecular para detectar la variación genética entre los organismos. Ambos métodos son igualmente importantes y tienen ventajas y desventajas. La diferencia clave entre AFLP y RFLP es que AFLP implica la amplificación selectiva de PCR del ADN digerido, mientras que RFLP no implica la amplificación selectiva de PCR de los fragmentos de ADN.

CONTENIDO
1. Descripción general y diferencia de claves
2. Que es AFLP
3. Que es rflp
4. Comparación de lado a lado - AFLP vs RFLP
5. Resumen

Que es AFLP?

AFLP (polimorfismo de longitud de fragmento amplificado) es una herramienta importante en la biología molecular y se usa ampliamente en el análisis de variación genética. AFLP se basa en la amplificación específica de PCR del ADN genómico fragmentado y la detección del polimorfismo por autorradiografías a través de la electroforesis en gel. AFLP contribuye ampliamente a la identificación de diferencias genéticas en cepas o especies estrechamente relacionadas de varios reinos, incluidas plantas, animales, bacterias y hongos. AFLP se puede llevar a cabo con pequeñas cantidades de muestras de ADN desconocidas. No requiere conocimiento de secuencia previa y diseño de sondas.

Pasos de AFLP

1. Aislamiento de ADN
2. Digestión del ADN con endonucleasas de restricción
3. Ligadura de los fragmentos de ADN restringidos con adaptadores
4. Amplificación selectiva de los fragmentos con sitios de restricción específicos
5. Separación de los productos de PCR por electroforesis en gel
6. Visualización de la matriz de gel por autorradiografía

AFLP es un método más sensible y reproducible que puede usarse en el perfil de ADN de varios taxones, incluidos hongos, bacterias, plantas y animales sin conocimiento previo de secuencias de ADN. Ayuda a identificar ligeras diferencias entre las personas en las poblaciones debido a su naturaleza altamente sensible. AFLP también es importante en el mapeo del genoma, los estudios forenses, las pruebas de los padres, el genotipado, etc.

Figura 01: AFLP

Que es rflp?

Restricción Longitud de fragmento Los polimorfismos (RFLP) es una técnica que se utiliza para detectar las variaciones genéticas en las secuencias de ADN homólogos. Es el primer método desarrollado para el perfil de ADN. Los organismos tienen huellas digitales de ADN o perfiles de ADN. RFLP sirve como una herramienta importante para analizar la variación entre los perfiles de ADN de organismos intraespecíficos o estrechamente relacionados, ya que las secuencias homólogas tienen diferentes sitios de restricción (ubicaciones) que son exclusivos de un organismo particular. Cuando el ADN homólogo se digiere con endonucleasas de restricción específicas, dará como resultado diferentes perfiles de ADN que son exclusivos de cada individuo. Por lo tanto, el principal de este método es la detección de la variación genética entre los organismos al restringir el ADN homólogo con enzimas de restricción específicas y el análisis del polimorfismo de longitud de fragmento a través de la electroforesis en gel y transferencia. Los patrones de transferencia son exclusivos de cada organismo y caracterizan los genotipos específicos.

Pasos de RFLP

1. Aislamiento de una cantidad suficiente de ADN de muestras
2. Fragmentación de las muestras de ADN con endonucleasas de restricción específicas en secuencia corta
3. Separación de los fragmentos resultados con diferentes longitudes por electroforesis en gel de agarosa.
4. Transferencia del perfil de gel a una membrana por Southern Blotting

5. Hibridación de la membrana con sondas marcadas y análisis del polimorfismo de longitud de fragmento en cada perfil

RFLP es una técnica muy importante para detectar la herencia de la enfermedad y encontrar el riesgo de que ocurra la enfermedad entre los miembros de la familia. RFLP también se usa con frecuencia en el mapeo del genoma, identificando criminales en forense, pruebas de paternidad, etc. RFLP también tiene varias limitaciones. RFLP requiere el conocimiento previo de los datos de secuencia para diseñar sondas para la hibridación. También requiere el aislamiento de una cantidad suficiente de ADN de la muestra para analizar, lo cual es difícil en estudios forenses.

Figura 01: mapeo RRFLP

¿Cuál es la diferencia entre AFLP y RFLP??

Resumen -AFLP vs RFLP

AFLP y RFLP son dos técnicas utilizadas como marcadores genéticos para la evaluación de la diversidad y la evaluación de las relaciones genéticas en la biología molecular. AFLP sirve como un método eficiente y sensible para la detección del polimorfismo genético entre organismos que RFLP. Sin embargo, aunque ambos métodos tienen diferentes eficiencias en la detección de variaciones genéticas, todavía se usan para las huellas dactilares de ADN y el diagnóstico de enfermedades.

Referencia:
'1. García, Antonio A. F., Luciana l. Benchimol, Antônia M. METRO. Barbosa, Isaias O. Geraldi, Souza Jr. Cláudio l., y anete p. De Souza. "Comparación de marcadores RAPD, RFLP, AFLP y SSR para estudios de diversidad en líneas endogámicas de maíz tropical."Genética y biología molecular. Sociedade Brasileira de Genética, 2004. Web. 19 mar. 2017
2. "Polimorfismo de longitud de fragmento de restricción (RFLP)."Centro Nacional de Información de Biotecnología. U.S. Biblioteca Nacional de Medicina, N.d. Web. 19 mar. 2017
3. Masiga D. K. y Turner C. METRO. (2004). "Análisis de polimorfismo de longitud de fragmento amplificado (restricción) (AFLP)". Métodos Mol Biol: 270: 173-86. NCBI. Web. 19 mar. 2017

Imagen de cortesía:
1. "ALFP" de Barbarssa en Dutch Wikipedia - Transferido desde NL.Wikipedia a los comunes. (Dominio público) a través de Commons Wikimedia
2. "Mapeo RFLP" de Retama - Trabajo propio (GFDL) a través de Commons Wikimedia