Diferencia entre la ligadura de extremo roma y pegajoso

Diferencia entre la ligadura de extremo roma y pegajoso

Diferencia clave: ligadura de extremo roma vs pegajoso
 

Las endonucleasas de restricción son enzimas específicas que cortan el ADN de doble cadena (dsDNA). También se conocen como tijeras moleculares en biología molecular. Las enzimas de restricción pueden reconocer secuencias cortas específicas del dsDNA conocido como sitios de reconocimiento y escindir fosfodiéster e enlaces de hidrógeno para abrir cadenas dobles. Como resultado de la escisión por estas enzimas, los fragmentos de ADN se producen con diferentes tipos de extremos, como extremos adhesivos y extremos contundentes. La ADN ligasa es una enzima utilizada en la biología molecular para unir dos hilos adyacentes de ADN formando nuevos enlaces. El paso se conoce como ligadura y de acuerdo con el tipo del extremo de ADN ligado, se puede denominar como ligadura de extremo contundente y ligadura de extremo pegajoso. La diferencia clave entre la ligadura de extremo roma y pegajoso es que La ligadura de extremo contundente ocurre entre fragmentos de ADN que contienen dos extremos romos mientras La ligadura de extremo pegajoso ocurre entre 5 'y 3' los voladizos. En comparación con la ligadura de extremo roma, la ligadura de extremo adhesado es más eficiente y estable.

CONTENIDO
1. Descripción general y diferencia de claves
2. ¿Qué es la ligadura de extremo contundente?
3. ¿Qué es la ligadura de extremo pegajoso?
4. Comparación de lado a lado: ligadura de extremo roma vs pegajoso
5. Resumen

¿Qué es una ligadura de extremo contundente??

Algunas endonucleasas de restricción pueden cortar el ADN en las bases opuestas y producir fragmentos de ADN extremo. Estas enzimas se conocen como cortadores de extremo contundente; Se escinden directamente hasta el medio del sitio de restricción sin dejar bases de sobresalto de una sola varada. Los extremos contundentes también se conocen como fines no superpuestos, ya que no tienen bases que sobresalen de 3 'y 5' en los extremos. Ambos hilos terminan de pares de bases en extremos contundentes. Las enzimas de corte de extremo contundente son ecorv haeiii, alui y smai.

La ligadura de extremo contundente está involucrada entre dos extremos contundentes. No es una ligadura de bases sobresalientes. Esta ligadura es menos eficiente que la ligadura de extremo pegajoso. Sin embargo, en algunas ocasiones, la ligadura de extremo contundente se vuelve más ventajoso que la ligadura de extremo pegajoso, especialmente al ligar los productos de PCR. Los productos de PCR siempre se producen con extremos contundentes. La ligadura de extremo contundente no requiere extremos complementarios en el ADN para la ligadura.

Figura 01: Producción de extremo contundente por enzima Eco RV

¿Qué es una ligadura de extremo pegajoso??

Algunas endonucleasas de restricción pueden cortar dsDNA, dejando una pieza de ADN monocatenial al final al final. Estos extremos se conocen como extremos pegajosos o sobresalientes. La ligadura de extremo pegajoso ocurre entre dos fragmentos de ADN que contienen voladizos coincidentes porque los extremos pegajosos se poseen con bases no apareadas y requieren bases complementarias para formar enlaces. Por lo tanto, es necesario utilizar la misma enzima de restricción para ambas fuentes de ADN para producir los fragmentos ligeros coincidentes.

La ligadura de extremo pegajoso es más eficiente y a menudo es muy deseable en los procesos de clonación. Hay varias enzimas de restricción que producen extremos pegajosos. Son ecori, bamhi, hindiii, etc.

Figura 02: Producción de extremo adhesado por Eco Ri Enzyme

¿Cuál es la diferencia entre la ligadura de extremo roma y pegajoso??

 Blunt vs Sticky End Ligation

La ligadura de extremo roma ocurre entre dos fragmentos de ADN extremo roma. La ligadura de extremo pegajoso ocurre entre dos fragmentos de ADN a juego con extremos pegajosos.
Enzimas
Los cortadores de extremo contundente producen extremos contundentes. Los cortadores de extremo pegajoso producen extremos pegajosos o cohesivos.
Requisito de extremos coincidentes
No requiere fragmentos coincidentes o bases complementarias. Requiere bases complementarias en los extremos para formar pares de bases.
Eficiencia
Es menos eficiente que la ligadura de extremo pegajoso Es más eficiente que la ligadura de extremo contundente.

Resumen -Blunt vs Sticky End Ligation

Las endonucleasas de restricción pueden escindir dsDNA y producir fragmentos de ADN con diferentes extremos. Reconocen secuencias específicas y restringen la creación de ADN para los extremos pegajosos y contundentes. Los extremos pegajosos tienen bases no apareadas al final de los fragmentos. Los extremos contundentes se crean debido a un escote recto y tienen pares de bases en los extremos. La ligadura de extremo pegajoso requiere dos piezas complementarias de ADN monocatenarios. La ligadura de extremo contundente ocurre entre dos fragmentos de extremo roma. Esta es la diferencia entre ligadura roma y pegajosa.

Referencias:
1. Roberts, Richard J. "Cómo se convirtieron la enzimas de restricción en los caballos de batalla de la biología molecular." Procedimientos de la Academia Nacional de Ciencias. National Acad Sciences, N.d. Web. 12 de abril. 2017
2. Adnan, Amna. Usos de enzimas de restricción en biotecnología. norte.pag., norte.d. Web. 12 de abril. 2017

Imagen de cortesía:
1. "Sitio de restricción de ECORV.RSH ”por Ramin Herati - Creado con Inkscape (dominio público) a través de Commons Wikimedia
2. "Restricción enzima ecológica" de Tinastella - Trabajo propio (dominio público) a través de Commons Wikimedia