Diferencia entre el gen candidato y los GWAS

Diferencia entre el gen candidato y los GWAS

El diferencia clave entre el gen candidato y gwas es que El enfoque del gen candidato investiga la variación genética dentro de un pequeño número de genes de interés preespecificados, mientras que GWAS investiga todo el genoma para una variación genética común detrás de una enfermedad particular.

El enfoque genético candidato y los estudios de asociación de todo el genoma (GWAS) son dos métodos que son importantes para detectar la susceptibilidad genética a las enfermedades. El enfoque del gen candidato se basa en un pequeño número de genes preespecificado, mientras que GWAS se basa en probar todo el genoma. Por lo tanto, el enfoque del gen candidato requiere un conocimiento previo de los genes con relevancia para la enfermedad, a diferencia de GWAS.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia de claves
2. ¿Qué es el gen candidato? 
3. Que es gwas
4. Similitudes entre el gen candidato y GWAS
5. Comparación de lado a lado: gen candidato vs GWAS en forma tabular
6. Resumen

¿Qué es el gen candidato??

El enfoque del gen candidato es una de las técnicas que investiga la asociación entre la variación genética dentro de los genes de interés y fenotipos previamente especificados y los estados de enfermedades. En este enfoque, es necesario tener un conocimiento previo del impacto funcional biológico del gen en el rasgo o la enfermedad en cuestión. Según este conocimiento, se seleccionan y analizan un pequeño número de genes para la variación genética.

Figura 01: Enfoque de genes candidatos

La selección de los genes se realiza en función de la relevancia biológica, fisiológica y funcional para la enfermedad en cuestión en este enfoque. Este enfoque a menudo está diseñado como un estudio de casos y controles.

Que es gwas?

GWAS significa Estudio de asociación en todo el genoma. También se refiere a estudios de asociación de genoma completo. Estos estudios se centran principalmente en estudios de observación. Analizan las variantes genéticas de diferentes individuos generalmente asociadas con un rasgo específico. Todo el genoma es importante para el análisis de GWAS.

GWAS es una herramienta importante en el análisis de los polimorfismos de un solo nucleótido asociados con diversas enfermedades. Es un estudio comparativo de los diferentes polimorfismos de un solo nucleótido en una amplia población. La muestra de estudio de GWAS es muy alta; Por lo tanto, también toma el formato de un estudio de cohorte transversal.

Figura 02: GWAS

El primer estudio de GWAS tuvo lugar con respecto al infarto de miocardio y el análisis de los genes asociados con el infarto de miocardio. En la actualidad, GWAS juega un papel importante en la determinación de los antecedentes genéticos de enfermedades complejas con etiología desconocida.

¿Cuáles son las similitudes entre el gen candidato y los gwas??

  • Tanto el enfoque del gen candidato como los GWA son técnicas que analizan la asociación genética entre el genotipo y el fenotipo de la enfermedad.
  • Ambos enfoques ayudan a comprender la base genética de la susceptibilidad a la enfermedad.

¿Cuál es la diferencia entre el gen candidato y los gwas??

El enfoque del gen candidato se basa en los genes candidatos o los genes preespecificados, mientras que GWAS se basa en todo el genoma. Entonces, esta es la diferencia clave entre el gen candidato y los gwas. Además, en el enfoque de genes candidatos, la selección de genes es necesaria, mientras que no es necesaria en GWAS.

Además, el enfoque del gen candidato requiere un conocimiento previo sobre los genes relevantes para la enfermedad, mientras que no es necesario para GWAS.

A continuación, la infografía proporciona una comparación más detallada relacionada con la diferencia entre el gen candidato y GWAS.

Resumen - Gene candidato vs GWAS

El gen candidato y los GWA son dos estudios de asociación de genes. El enfoque de genes candidatos se centra en la variación genética asociada con la enfermedad dentro de un pequeño número de genes preespecificados. En contraste, GWAS investiga la variación genética asociada con la enfermedad dentro de todo el genoma. Entonces, esta es la diferencia clave entre el gen candidato y los gwas. Ambos métodos son importantes para comprender la base genética de la susceptibilidad a la enfermedad.

Referencia:

1. "Gene candidato: una descripción general | Temas de ciencias científicas ". Con ciencias.Com, 2020, disponible aquí.
2. "Gene candidato". Interno.Wikipedia.Org, 2020, disponible aquí.

Imagen de cortesía:

1. "Ranking-defactable-génes-generales-de-expresión-expresión y proteína-interacción-a-katz-centro-centavo.0024306.G001 ”por Zhao J, Yang T, Huang Y, Holme P - Archivo de imagen de Zhao J, Yang T, Huang Y, Holme P (2011). "Clasificación de genes de la enfermedad candidata a partir de la expresión génica y la interacción de proteínas: un enfoque basado en la cortesía en katz". MÁS UNO. Doi: 10.1371/diario.pan de maíz.0024306. PMID 21912686. PMC: 3166320 (CC por 3.0) a través de Commons Wikimedia
2. "Parcela de Manhattan" de M. Kamran Ikram et al - Ikram Mk et al (2010) Cuatro loci nuevos (19q13, 6q24, 12q24 y 5q14) influyen en la microcirculación in vivo. PLoS Genet. 2010 el 28 de octubre; 6 (10): E1001184. doi: 10.1371/diario.pGen.1001184.G001 (CC por 2.5) Vía Commons Wikimedia