Diferencia entre CD y ORF

El diferencia clave entre CDS y ORF es que CDS es que la secuencia real de nucleótidos de un gen que se traduce en una proteína, mientras que ORF es un tramo de secuencia de ADN que comienza con el sitio de inicio de traducción (Codon de inicio) y termina con un sitio de terminación de traducción (Codón de parada).

Un gen tiene una secuencia de codificación (CDS). Consiste en exones totales del gen y un codón de inicio y un codón de parada. Es la parte real del gen que traduce y produce la proteína. Marco de lectura abierto o ORF es una secuencia de nucleótidos ubicada entre un codón de inicio y un codón de parada. No hay codón de parada dentro de un ORF que interrumpe el código genético que se traduce en una proteína. En procariotas, los CD y el ORF de un gen son los mismos.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia de claves
2. ¿Qué es CDS? 
3. Que es orf
4. Similitudes entre CD y ORF
5. Comparación de lado a lado: CDS vs ORF en forma tabular
6. Resumen

¿Qué es CDS??

CDS o secuencia de codificación es la parte del gen que en realidad se traduce en una proteína. Se compone de exones y dos codones conocidos como Aug Codon y Stop Codon. CDS no contiene dos regiones no traducidas: 5 'UTR y 3 "UTR. Además, los intrones no están incluidos en CDS.

Figura 01: secuencia de codificación

En comparación con todo el genoma de un individuo, las secuencias de codificación son una pequeña fracción. La secuencia de codificación consiste en la secuencia de nucleótidos necesaria para hacer la secuencia de aminoácidos de la proteína. Por lo tanto, los CD son exones concentrados que se pueden dividir en trillizos o codones de nucleótidos. Los codones dan lugar a aminoácidos.

Que es un orf?

El marco de lectura abierto u ORF es el estiramiento continuo de una secuencia de nucleótidos que comienza con un codón de inicio y termina con un codón de parada. En palabras simples, ORF se refiere a la región de la secuencia de nucleótidos ubicada entre codones de inicio y parada. En el medio, no hay un codón de parada que interrumpa el ORF. La secuencia de nucleótidos entre los codos de inicio y el codón de parada para los aminoácidos. En general, el codón de inicio es ATG, mientras que los codones de parada son TAG, TAA y TGA. ORF proporciona una proteína funcional cuando se transcribe y traduce. Por lo tanto, ORF incluye un codón de inicio, varios codones en la región media y un codón de parada. Curiosamente, ORF tiene una longitud que puede dividirse por tres.

Figura 02: Marco de lectura abierto

En procariotas, dado que no hay intrones, ORF es la secuencia de codificación de un gen que se transcribe directamente al ARNm. Por lo tanto, los CD y el PRF son los mismos en los procariotas. Al buscar genes en procariotas, es fácil detectar un ORF y encontrar un gen en procariotas.  En eucariotas, dado que hay intrones, ORF es la secuencia de codones que se forma después del procesamiento o el empalme de ARN. ORF es una evidencia que ayuda a la predicción del gen, ya que es probable que ORF sea parte de un gen.

¿Cuáles son las similitudes entre CD y ORF??

• En procariotas, CD y ORF son los mismos.
• Ambos tienen codón de inicio y codón de parada.
• Tienen varios nucleótidos que pueden dividirse por tres.
• Una vez que traducen, producen secuencias de aminoácidos.

¿Cuál es la diferencia entre CD y ORF??

CDS es la parte real del gen que se traduce en una proteína, mientras que ORF es el estiramiento de ADN entre un codón de inicio y un codón de parada. Entonces, esta es la diferencia clave entre CD y ORF. Además, los CD no contienen intrones, pero ORF puede contener intrones. CDS se transcribe completamente en una secuencia de ARNm completa, mientras que el ORF puede ser parte de la secuencia de ARNm. Por lo tanto, esta es otra diferencia entre CD y ORF.

ABAJO Tabulados de la infografía uno al lado del otro la diferencias entre CD y ORF.

Resumen -CDS vs ORF

CDS y ORF son dos partes importantes de un gen. CDS se refiere a la región real de ADN que se traduce en una proteína. ORF es una secuencia de ADN que comienza con el codón de inicio "ATG" y termina con cualquiera de los tres codones de terminación (TAA, TAG o TGA). ORF puede ser parte del ARNm completo de un gen. Sin embargo, la secuencia de codificación de un gen se transcribe para completar la secuencia de ARNm. Todos los CDS son ORFS. Pero no todos los ORF son CDSS. Por lo tanto, esto resume la diferencia entre CD y ORF.

Referencia:

1. "Marco de lectura abierto."Wikipedia, Fundación Wikimedia, 27 de noviembre. 2020, disponible aquí.

Imagen de cortesía:

1. "Región de codificación en ADN" por Pragpats - Trabajo propio (CC BY -SA 4.0) a través de Commons Wikimedia
2. "Sampleorf" de Luongdl - Trabajo propio (dominio público) a través de Commons Wikimedia