Diferencia entre cromosomas caminar y saltar

Diferencia clave: cromosoma caminando contra saltos
 

Caminar cromosomas y saltos de cromosomas son dos herramientas técnicas utilizadas en biología molecular para localizar genes en los cromosomas y el mapeo físico de los genomas. El cromosoma caminar es una técnica utilizada para clonar un gen objetivo en una biblioteca genómica mediante un aislamiento repetido y clonación de clones adyacentes de la biblioteca genómica. El salto cromosómico es una versión especial de la caminata cromosómica que supera los puntos de interrupción de la caminata cromosómica. La caminata cromosómica solo puede secuenciar y mapear pequeñas longitudes de cromosomas, mientras que el salto cromosómico permite la secuenciación de grandes partes de los cromosomas. Esta es la diferencia clave entre la caminata cromosómica y el salto cromosómico.

CONTENIDO
1. Descripción general y diferencia de claves
2. ¿Qué es el cromosoma caminando?
3. ¿Qué es el salto de cromosoma?
4. Comparación de lado a lado - Caminata cromosómica vs salto
5. Resumen

¿Qué es el cromosoma caminando??

El cromosoma caminar es una herramienta que explora las regiones de secuencia desconocidas de los cromosomas mediante el uso de fragmentos de restricción superpuesta. En la caminata cromosómica, una parte de un gen conocido se usa como sonda y continúa caracterizando la longitud completa del cromosoma a mapear o secuenciar. Esto va del marcador a la longitud del objetivo. En la caminata cromosómica, los extremos de cada fragmentos superpuestos se utilizan para la hibridación para identificar la siguiente secuencia.

Las sondas se preparan a partir de las piezas finales del ADN clonado y se subclonan. Luego se usan para encontrar el próximo fragmento superpuesto. Todas estas secuencias superpuestas se utilizan para construir el mapa genético del cromosoma y localizar los genes objetivo. Es un método para analizar largos tramos de ADN mediante pequeños fragmentos superpuestos de la biblioteca genómica reconstruida.

Técnica de caminata cromosómica - Pasos

1. Aislamiento de un fragmento de ADN que contiene el gen o marcador conocido cerca del gen objetivo

2. Preparación del mapa de restricción del fragmento seleccionado y subclonando la región final del fragmento para usar como sonda
3. Hibridación de la sonda con el próximo fragmento superpuesto
4. Preparación del mapa de restricción del fragmento 1 y subclonación de la región final del fragmento 1 para usar como sonda para la identificación del próximo fragmento superpuesto.
5. Hibridación de la sonda con el siguiente fragmento superpuesto 2

6. Preparación del mapa de restricción del fragmento 2 y la subclonación de la región final del fragmento 2 para servir como una sonda para la identificación del próximo fragmento superpuesto

Los pasos anteriores deben continuarse hasta el gen objetivo o hasta 3 'final de la longitud total de la secuencia.

Figura 01: técnica de caminata cromosómica

La caminata por el cromosoma es un aspecto importante de la citogenética para encontrar SNP de muchos organismos y analizar las enfermedades transmitidas genéticamente y encontrar mutaciones de genes relevantes.

¿Qué es el salto de cromosoma??

El salto cromosómico es una técnica utilizada en la biología molecular para el mapeo físico de los genomas de los organismos. Esta técnica se introdujo para superar una barrera de la caminata cromosómica que surgió al encontrar las regiones repetitivas de ADN durante el proceso de clonación. Por lo tanto, la técnica de salto cromosómica puede considerarse como una versión especial de la caminata cromosómica.  Es un método rápido en comparación con la caminata cromosómica y permite el omisión de las secuencias de ADN repetitivas que no son propensas a ser clonadas durante la caminata cromosómica. El salto cromosómico reduce la brecha entre el gen objetivo y los marcadores conocidos disponibles para el mapeo del genoma.

La herramienta de salto cromosómica comienza con el corte de un ADN específico con endonucleasas de restricción especiales y la ligadura de los fragmentos en bucles circularizados. Luego se usa un imprimador diseñado a partir de una secuencia conocida para secuenciar los bucles circularizados. Este cebador permite saltar y secuenciar de manera alternativa. Por lo tanto, puede omitir las secuencias repetitivas de ADN y caminar rápidamente a través del cromosoma para la búsqueda del gen objetivo.

El descubrimiento del gen codifica la enfermedad de la fibrosis quística se realizó utilizando la herramienta de salto cromosómica. Combinados, el salto y caminar cromosómicos puede mejorar el proceso de mapeo del genoma.

Figura 02: salto cromosómico

¿Cuál es la diferencia entre cromosomas caminar y saltar??

Resumen -cromosoma caminando contra saltos

La caminata cromosómica se aplica con frecuencia cuando se sabe que un gen en particular se encuentra cerca de un gen previamente clonado en un cromosoma y es posible identificarlo con un aislamiento repetido de clones genómicos adyacentes de la biblioteca genómica de la biblioteca genómica. Sin embargo, cuando se encuentran regiones repetitivas de ADN durante la técnica de caminata cromosómica, el proceso no puede continuarse. Por lo tanto, la técnica se rompe desde ese punto. El salto cromosómico es una herramienta biológica molecular que supera esta limitación para mapear genomas. Evita estas regiones repetitivas de ADN que son difíciles de clonar y ayuda en el mapeo físico de los genomas. Esta es la principal diferencia entre cromosomas caminando y saltos.

Referencias:
1. Nakaseko, Yukinobu, Yasuhisa Adachi, Shin-Ichi Funahashi, Osami Niwa y Mitsuhiro Yanagida. “Caminar cromosomas muestra una secuencia repetitiva altamente homóloga presente en todas las regiones de centrómeros de la levadura de fisión."The Embo Journal. U.S. Biblioteca Nacional de Medicina, mayo de 1986. Web. 22 mar. 2017
2. Taheri, Ali. "Caminar y saltar cromosomas."Avances en ingeniería genética. Omics International, 30 de octubre. 2013. Web. 22 mar. 2017