Diferencia entre clon por secuenciación clon y secuenciación de escopeta

El diferencia clave Entre el clon por secuenciación clon y la secuenciación de escopeta se encuentra en su método de conducta. El método de secuenciación del clon por clon implica el mapeo de cromosomas y la clonación antes de la secuenciación, mientras que el clon por secuenciación de escopeta omite tanto el mapeo de cromosomas como los pasos de clonación durante la secuenciación.

Clon por secuenciación de clon y clon por secuenciación de escopeta son dos métodos de secuenciación del genoma moderno. La secuenciación del clon por clon es un método de secuenciación más confiable. Sin embargo, el método de clon por secuenciación de escopeta es más rápido y barato. El artículo se centra en la diferencia sutil entre el clon por secuenciación de clones y la secuencia de escopeta.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia de claves
2. ¿Qué es clon por secuenciación clon? 
3. ¿Qué es clon por secuenciación de escopeta?
4. Similitudes entre clon por secuenciación clon y secuenciación de escopeta
5. Comparación de lado a lado: clon por secuenciación de clonos versus secuenciación de escopeta en forma tabular
6. Resumen

¿Qué es clon por secuenciación clon??

La secuenciación del clon por clon es un método de secuenciación del genoma. Requiere el mapeo de cada cromosoma antes de la división de ADN. Después del mapeo, el ADN debe descomponerse en fragmentos de 150 kilobases de largo. Estos fragmentos están listos para secuenciar. El siguiente paso es la inserción de fragmentos de ADN en cromosomas artificiales bacterianos (BAC) y luego en células bacterianas. Dado que los fragmentos ahora están dentro de las células bacterianas, cada vez que las bacterias se dividen, los fragmentos de ADN insertados también se dividen y producen muchas copias idénticas. Luego, el ADN del clon bacteriano individual se fragmenta en 500 fragmentos de par de pares de bases largos. Son fragmentos más pequeños y superpuestos. A continuación, la secuencia tiene lugar con la inserción de estos fragmentos en un vector con una secuencia de ADN conocida. A partir de la secuencia conocida del vector, la secuencia continúa hasta secuencia desconocida.

Después de terminar la secuenciación, es necesario identificar las áreas de secuencias superpuestas. A partir de entonces, la unión de los fragmentos tiene lugar para formar los fragmentos más grandes presentados inicialmente en BACS. A continuación, el ensamblaje de fragmentos más grandes en el cromosoma tiene lugar de acuerdo con el mapa del genoma.

Figura 01: Clon por secuenciación de clonos

La ventaja significativa del clon por secuenciación de clonos es que el mapa del genoma preparado ayuda a un ensamblaje confiable de fragmentos más grandes. Pero, la desventaja de este método de secuenciación es que es lento generar mapas del genoma y hacer clones. Sin embargo, este fue el método preferido durante el 'Proyecto del genoma humano'.

¿Qué es clon por secuenciación de escopeta??

El clon por la secuenciación de la escopeta es un método de secuenciación que divide aleatoriamente las secuencias de ADN en muchos fragmentos pequeños y vuelve a montar la secuencia observando las regiones superpuestas. Los genomas de mamíferos más grandes son difíciles de clonar y ensamblan. Se debe a su complejidad y tamaño estructurales. Aunque el método de secuenciación del clon por clon es confiable, lleva mucho tiempo secuenciar genomas de organismos complejos. Por lo tanto, el clon por secuenciación de escopeta se ha convertido en un método de secuenciación más barato confiable que se puede realizar más rápido. Por lo tanto, los científicos modernos confían en este método de secuenciación para abordar genomas complejos.

Figura 02: clon por secuenciación de escopeta

Durante el método de secuenciación de clonos por escopeta, no se producen pasos de mapeo y clonación del genoma convencional. Inicialmente, todo el genoma se fragmenta en diferentes tamaños de 20 kilobases a 300 kilobases. A continuación, se produce la secuencia. Luego, utilizando sofisticado software de computadora, es necesario ensamblar los fragmentos mirando las regiones superpuestas.

La secuenciación del clon por escopeta ayuda a mejorar la precisión de las secuencias del genoma existentes. La principal ventaja de este método es que es mucho más rápido y menos costoso que el clon por el método de secuenciación de clones. Sin embargo, este proceso no implica el uso de un mapa genético. Por lo tanto, los errores durante el ensamblaje tienen más probabilidades de ocurrir. Por lo tanto, esta es una gran desventaja en el clon por el método de secuenciación de la escopeta.

¿Cuáles son las similitudes entre el clon por secuenciación de clon y la secuenciación de escopeta??

• Tanto el clon por secuenciación clon y la secuenciación de escopeta son dos métodos de secuenciación del genoma.
• Durante ambas técnicas de secuenciación, el ensamblaje de fragmentos desglosados ​​tiene lugar identificando regiones superpuestas.
• Además, el desglose del ADN en fragmentos más pequeños es necesaria para la secuencia de clonos y de escopeta.

¿Cuál es la diferencia entre el clon por secuenciación de clon y la secuenciación de escopeta??

La técnica de secuenciación clon por clon implica dos pasos principales: mapeo de cromosomas y clonación. En contraste, el clon por secuenciación de escopeta no sigue estos dos pasos; Rompa aleatoriamente las secuencias de ADN en muchos pequeños fragmentos y vuelve a montar la secuencia observando las regiones superpuestas. Por lo tanto, esta es la diferencia clave entre el clon por secuenciación de clon y la secuenciación de escopeta. Debido a este factor, la secuenciación del clon por clon es un proceso costoso y que requiere mucho tiempo, mientras que el clon por secuenciación de escopeta es más rápido y más barato.

Sin embargo, los errores durante el ensamblaje tienen menos probabilidades de ocurrir durante el clon mediante secuenciación de clones. Por lo tanto, tiene una alta fiabilidad. Sin embargo, el clon por secuenciación de escopeta es relativamente una técnica menos confiable. Entonces, esta también es una diferencia significativa entre el clon por secuenciación de clon y la secuenciación de escopeta.

La siguiente información Graphic presenta más información sobre la diferencia entre el clon por secuenciación de clones y la secuenciación de escopeta.

Resumen -Clon por secuenciación de clones vs secuenciación de escopeta

Al resumir la diferencia entre el clon por secuenciación de clon y la secuenciación de escopeta, el clon por secuenciación de clon y la secuenciación de escopeta son dos métodos de secuenciación del genoma. Sin embargo, la técnica de secuenciación del clon por clon implica tanto los procesos de mapeo del genoma como la clonación, mientras que el clon por secuenciación de escopeta no. Entonces, esta es la diferencia clave entre el clon por secuenciación de clon y la secuenciación de escopeta. Dado que el mapeo del genoma se lleva a cabo durante el clon mediante secuenciación de clones, es menos probable que ocurran errores durante el ensamblaje de secuencias. Pero, el clon por la secuencia de escopeta es un proceso mucho más rápido y barato. Sin embargo, es relativamente menos confiable. La secuenciación del clon por clon fue el método de secuenciación preferido durante el 'Proyecto del Genoma Humano'. Pero, el biólogo molecular moderno se basa más en el clon por secuenciación de escopeta.

Referencia:

1. "¿Qué es la secuencia clon por clon??"Hechos, el equipo de participación pública en el campus del genoma de Wellcome, 17 de noviembre. 2014, disponible aquí.
2. "¿Qué es la secuenciación de escopeta??"Hechos, el equipo de participación pública en el campus del genoma de Wellcome, 17 de noviembre. 2014, disponible aquí.

Imagen de cortesía:

1. "Pasos de la clonación molecular" por SEXPICARDAL97 - Trabajo propio, CC By -SA 4.0) a través de Commons Wikimedia
2. "Secuenciación de escopeta LG" por el Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano - Institutos Nacionales de Salud. Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano. "Glosario de conversación de términos genéticos."Consultado el 17 de noviembre de 2016 (dominio público) a través de Commons Wikimedia