Diferencia entre PCR de consenso y PCR PAN

El diferencia clave Entre consenso PCR y PR PCR es que La PCR de consenso siempre se dirige a las regiones conservadas, mientras que la PCR PAN se dirige a regiones variables para identificar diferentes cepas de un grupo

La reacción en cadena de la polimerasa (PCR) es una técnica de amplificación de genes que consta de tres pasos principales como desnaturalización, recocido y extensión. Esto se usa ampliamente en diagnóstico e identificación molecular. Las técnicas de PCR de consenso y PCR se basan en los objetivos de imprimación que usa cada tipo de PCR.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia de claves
2. ¿Qué es PCR de consenso? 
3. ¿Qué es PR PCR?
4. Similitudes entre PCR de consenso y PCR PAN
5. Comparación de lado a lado: PCR de consenso vs PCR PAN en forma tabular
6. Resumen

¿Qué es PCR de consenso??

La PCR de consenso es una técnica de PCR que se dirige a una región conservada para una especie o géneros en particular. Por lo tanto, se eligen regiones altamente conservadas para la amplificación. A través de este método, los organismos pueden identificarse y distinguirse en función de su consenso. Este método identifica una región conservada para una especie en particular. Por ejemplo, la región de bacterias 16S rRNA sigue siendo una región conservada entre las bacterias. Por lo tanto, solo se requiere un conjunto de cebadores para la amplificación. En la mayoría de los casos, se puede usar un cebador universal específico para la región conservada.

Figura 01: técnica de PCR

Siguiendo un método de PCR de consenso, se pueden deducir la caracterización de especies y las relaciones evolutivas. Según la eficiencia de amplificación del organismo de muestra particular, el consenso del organismo hacia el grupo también se puede deducir. Además, la realización de una PCR de consenso es vital en estudios filogenéticos. Permite la identificación de una especie e interpreta la desviación del organismo particular que se muestra en términos del ancestro común.

¿Qué es PR PCR??

Una PCR PAN es un modo de multiplexación de PCR. En esta técnica, se amplifican diferentes cepas utilizando varios objetivos de cebadores. Sin embargo, los objetivos pueden ser objetivos comunes para los grupos de deformación. Por lo tanto, en la PCR PAN, se pueden usar más de dos conjuntos de cebadores en un solo tiempo. Puede tener lugar en un método de reacción de un solo tubo o como un método de reacción de múltiples tubos. PAN PCR lleva más tiempo y es más complejo en comparación con una PCR de consenso. Debido a esta razón, la interpretación de los resultados de la PCR también puede ser más compleja en PCR PCR.

La aplicación principal de PCR PCR está en diagnóstico molecular. Permite distinguir entre diferentes cepas de una especie por amplificación objetivo. PAN PCR es una técnica ideal para identificar diferentes cepas de una sola especie que causa una enfermedad. En la mayoría de los casos, la automatización de las técnicas de PCR PAN para diversas condiciones de salud es muy importante y es una técnica confiable y altamente eficiente.

¿Cuáles son las similitudes entre PCR de consenso y PCR PAN??

• PCR de consenso y PCR de PAN son dos tipos de técnicas de PCR.
• Ambos procedimientos siguen el procedimiento general de tres pasos: desnaturalización, recocido y extensión.
• Usan cebadores que son específicos de objetivo.
• Ambas reacciones tienen lugar en un ciclador térmico.
• Estas reacciones se pueden automatizar.
• Ambos se pueden usar en diagnósticos moleculares e identificación; Sin embargo, la precisión varía.
• Estos procedimientos requieren validación.

¿Cuál es la diferencia entre PCR de consenso y PCR PAN??

Tanto el consenso como la PCR PAN siguen el mismo procedimiento de rutina. Sin embargo, la diferencia clave entre la PCR de consenso y la PCR de PAN se basa en los objetivos del cebador que utiliza cada procedimiento. Si bien la PCR de consenso siempre se dirige a regiones conservadas, una PCR PCR se dirige a regiones variables para identificar diferentes cepas de un grupo. Debido a esta diferencia, los protocolos de diseño de cebadores, el número de conjuntos de cebadores utilizados y las aplicaciones específicas varían.

La siguiente infografía resume la diferencia entre PCR de consenso y PCR PCR.

Resumen -PCR de consenso VS PCR PCR

La PCR, introducida por Mulli, juega un papel revolucionario importante en las aplicaciones de biología molecular. Consenso y PCR PAN son dos tipos de PCR basados ​​en sus regiones objetivo de imprimación. Mientras que el consenso PCR se dirige a las regiones conservadas, PAN PCR se dirige a regiones variables y juega un papel importante en la identificación de la tensión. Debido a esta diferencia básica entre la PCR de consenso y la PCR PAN, las funciones específicas de cada tipo de PCR también varían del análisis filogenético a la caracterización molecular al diagnóstico molecular.

Referencia:

1. Merkelbach-Bruse, S, et al. “Reacción en cadena de la polimerasa consenso y ensayo inmunosorbente ligado a la enzima para la detección del papiloma humano y la tipificación de muestras cervicales."Patología molecular de diagnóstico: The American Journal of Surgical Pathology, Parte B, U.S. Biblioteca Nacional de Medicina, Mar. 1999, disponible aquí.
2. Yang, Joy Y, et al. “Pan-PCR, un método computacional para diseñar ensayos de tipo bacterias basados ​​en datos de secuencia de genoma completo."Journal of Clinical Microbiology, American Society for Microbiology, MAR. 2013, disponible aquí.

Imagen de cortesía:

1. "Reacción en cadena de la polimerasa" por Enzoklop - Trabajo propio (CC BY -SA 3.0) a través de Commons Wikimedia