El diferencia clave entre dntp y ddntp es que DNTP o desoxirribonucleótidos son los bloques de construcción del ADN y tienen un 3ʹ-OH Grupo en la estructura de azúcar pentosa, mientras que los trifosfatos DDNTP o didesoxinucleósidos son nucleótidos que carecen 3ʹ-OH Group y se usan en la técnica de secuenciación de ADN de Sanger Dideoxy para producir secuencias de ADN de diferentes longitud.
dntp y ddntp son nucleótidos. DNTP se refiere a los nucleótidos de desoxirribosa. Son los componentes básicos del ADN. Los DNTP se utilizan para sintetizar el ADN. DNTP, por otro lado, se refiere a los trifosfatos de dideoxinucleósido. Se usan en la secuenciación de Sanger para terminar la síntesis de ADN a diferentes longitudes. Carecen de oh grupo en 3ʹ posición. Un hidrógeno está presente en la posición 3ʹ en lugar del grupo OH. Por lo tanto, los DDNTP no pueden formar un enlace fosfodiéster con el siguiente nucleótido. DNTP es capaz de llevar a cabo la síntesis de ADN, mientras que DDNTP es capaz de terminar la polimerización del ADN.
1. Descripción general y diferencia de claves
2. Que es dntp
3. Que es ddntp
4. Similitudes entre dntp y ddntp
5. Comparación de lado a lado - DNTP vs DDNTP en forma tabular
6. Resumen
DNTP significa nucleótido de desoxirribosa o desoxirribonucleótido. Es el bloque de construcción del ADN. Hay cuatro tipos de dntps. Son DATP, DTTP, DCTP y DGTP. Se nombran de acuerdo con las bases nitrogenas de purina o pirimidina: adenina (A), guanina (G), timina (T) y citosina (C).
Figura 01: DNTP
La adenina y la guanina son bases de purina, mientras que la timina y la citosina son bases de pirimidina. El azúcar pentosa de DNTP es desoxirribosa. También hay un grupo de fosfato. Por lo tanto, DNTP está compuesto por tres componentes: una base nitrogenada, azúcar de desoxirribosa y un grupo de fosfato. Estos DNTP se combinan entre sí a través de enlaces de fosfodiéster. En DNTP, hay un grupo OH unido a la posición 3ʹ de azúcar pentosa que se requiere para formar un vínculo con el grupo fosfato unido al carbón 5ʹ del azúcar del siguiente nucleótido. Dado que todos los DNTP tienen este grupo 3ʹ -Oh, son capaces de sintetizar y extender los hilos de ADN. Por lo tanto, DNTP actúa como la unidad repetida básica de ADN y la materia química de los genes. La síntesis de ADN siempre procede de 5ʹ a 3ʹ.
La secuencia de Sanger es un método de secuenciación de ADN de primera generación desarrollado por Frederick Sanger y sus universidades en 1977. También se conoce como secuenciación de terminación de cadena o secuenciación de dideoxi, ya que el principio básico de este método es la terminación de la cadena utilizando trifosfatos de dedoxinucleósidos (DDNTP). Los DDNTP son nucleótidos utilizados en la secuenciación de Sanger. La secuenciación de Sanger se basa en la incorporación selectiva de DDNTP y la terminación de la síntesis de ADN durante el in vitro Replicación de ADN. La especialidad de los DDNTP es que carecen del grupo 3ʹ-OH en el azúcar pentosa para continuar la formación de enlaces de fosfodiéster entre el grupo fosfato de 5ʹ en el nucleótido adyacente. Por lo tanto, una vez que un DDNTP está unido a la cadena extendida, el alargamiento de la cadena cesa y termina desde ese punto. Los DDNTP actúan como inhibidores de la cadena de la ADN polimerasa durante el método de secuenciación de Sanger.
Figura 02: DDNTP
Hay cuatro DDNTP: DDATP, DDCTP, DDGTP y DDTTP utilizados en la secuenciación de Sanger. Estos nucleótidos detienen el proceso de replicación del ADN cuando se incorporan al creciente hilo de ADN. Como resultado, la secuenciación de Sanger produce longitudes variables de ADN corto. La electroforesis en gel capilar se utiliza para organizar estos hilos de ADN cortos por sus tamaños en un gel. Los DDNTP están marcados de forma radioactiva o fluorescente con diferentes colores para la facilidad de analizar la secuencia de ADN. Al analizar el gel, se puede determinar la secuencia de nucleótidos de la cadena de ADN desconocido.
DNTP es uno de los cuatro tipos de desoxirribonucleótidos que son bloques de construcción de ADN. DDNTP es uno de los cuatro tipos de trifosfatos de dedoxirribonucleósidos utilizados en la técnica de secuenciación de Sanger. DNTP tiene un grupo 3ʹ-OH en el azúcar pentosa, mientras que DDNTP carece de grupo 3ʹ-OH en el azúcar pentosa. Por lo tanto, esta es la diferencia clave entre dntp y ddntp. Además, los DNTP llevan a cabo la polimerización del ADN, mientras que los DDNTP terminan la polimerización de ADN. Por lo tanto, esta es otra diferencia importante entre DNTP y DDNTP.
La siguiente infografía enumera las diferencias entre DNTP y DDNTP en forma tabular.
Los DNTP normales son bloques de construcción de ADN, mientras que los DDNTP son nucleótidos utilizados en la técnica de secuenciación de Sanger. dntp tiene 3ʹ-oh, mientras que ddntp carece de 3ʹ-oh. Por lo tanto, esta es la diferencia clave entre dntp y ddntp. Además, DNTP puede sintetizar una cadena de ADN, mientras que DDNTP puede terminar la polimerización de ADN. Por lo tanto, los DDNTP se usan en la secuenciación de Sanger para producir diferentes hilos de ADN con diferentes longitudes. Durante la secuenciación de Sanger, se incluyen tanto DNTP como DDNTP.
1. "Dideoxinucleótido."Wikipedia, Fundación Wikimedia, 12 de julio de 2020, disponible aquí.
2. "Estructura y función del ADN.Lumen, disponible aquí.
1. "Desoxyribonucleótidos" Par Bionet - Personal de pañuelos (CC0) a través de Commons Wikimedia
2. "Terminación del dideoxi del alargamiento del ADN en" por Michał Sobkowski - Trabajo propio (CC por 3.0) a través de Commons Wikimedia