Diferencia entre exoma y transcriptoma

Diferencia de claves - Exome vs Transcriptome
 

Un gen contiene regiones de codificación y no codificantes dentro de él. Las secuencias de codificación se conocen como exones, y las secuencias no codificantes se conocen como intrones.  La secuencia de nucleótidos de los exones de un gen representa el código genético del gen para sintetizar la proteína específica. Por lo tanto, los exones permanecen en la molécula de ARNm. La región total de exón del genoma se conoce como exoma, y ​​es una parte importante del genoma. El código genético de los genes se convierte en el código genético de la molécula de ARNm, que se necesita para la producción de proteína. Todas las moléculas de ARNm transcritas en una célula o una población de células a la vez se conoce como transcriptoma. La diferencia clave entre el exoma y el transcriptoma es que El exoma representa las secuencias de las regiones de exón del genoma mientras El transcriptoma representa el ARNm total de una célula o un tejido en un momento dado.

CONTENIDO
1. Descripción general y diferencia de claves
2. Que es exoma
3. ¿Qué es el transcriptoma?
4. Comparación de lado a lado - Exome vs Transcriptome
5. Resumen

Que es exoma?

Los genes están compuestos de exones, intrones y secuencias regulatorias. Los exones son las regiones genéticas que se transcriben en secuencia de ARNm durante la transcripción. Los intrones y otras regiones no codificantes se eliminan durante la transcripción. La secuencia de nucleótidos de exones determina el código genético del gen que sintetiza la proteína específica que codifica. Solo los exones permanecen dentro del ARNm de una proteína. La colección de exones en el genoma se conoce como exoma de un organismo. Representa una parte del genoma que se expresa en genes. En humanos, el exoma representa el 1% del genoma. Es la porción de codificación de proteínas del genoma humano.

Figura 01: Exoma

¿Qué es el transcriptoma??

El transcriptoma es la recopilación de todas las transcripciones de codificación de proteínas y no codificantes (ARN) en un tejido dado. El transcriptoma representa la recolección de moléculas de ARNm totales expresadas por los genes en una célula o un tejido. El transcriptoma de una celda se puede variar con el transcriptoma de otro tipo de celda. El transcriptoma también es dinámico: cambia con el tiempo en respuesta a estímulos internos y externos. Incluso dentro del mismo tejido o dentro del mismo tipo de célula, el transcriptoma puede cambiar después de unos minutos.

El transcriptoma difiere del exoma de un organismo. El transcriptoma incluye solo las secuencias de exoma expresadas. Aunque el exoma de una célula sigue siendo el mismo, el transcriptoma difiere entre las células, ya que la expresión génica no es la misma para todas las células o tejidos. Solo los genes esenciales se expresan en diferentes células y tejidos. La expresión génica es un proceso específico de tejido o tipo célula. Está regulado por varios factores, incluidos los factores ambientales. Por lo tanto, el transcriptoma puede variar con condiciones ambientales externas.

El transcriptoma se usa como precursor de los estudios de proteómica. Todas las proteínas se derivan de secuencias de ARNm. Las modificaciones traslacionales pueden dar lugar a los cambios en las proteínas. Sin embargo, el transcriptoma proporciona información básica importante para los estudios proteómicos.

Figura 02: Transcriptoma de células madre embrionarias

¿Cuál es la diferencia entre exoma y transcriptoma??

Resumen -Exome vs Transcriptome

Los exones son las secuencias de codificación de los genes y determinan las secuencias de ARNm de las proteínas. La colección de estas secuencias de codificación (exones) se conoce como exoma de un organismo. Los genes se transcriben en moléculas de ARNm antes de hacer proteínas. Las moléculas de ARNm totales de una célula o un tejido en cualquier momento dado se conocen como transcriptoma. El transcriptoma representa los genes que se expresan activamente en ARNm en un momento dado. El transcriptoma es específico de células y tejidos y afecta con las condiciones ambientales. Esta es la diferencia entre el exoma y el transcriptoma.

Referencias:
1.Sarah et al, “Captura dirigida y secuenciación masivamente paralela de doce exomas humanos." Naturaleza. U.S. Biblioteca Nacional de Medicina, 10 de septiembre. 2009. Web. 01 de abril. 2017
2.Mutz et al. "Análisis del transcriptoma utilizando secuenciación de próxima generación."Elsevier: Localizador de artículos. norte.pag., Septiembre. 2012. Web. 01 de abril. 2017

Imagen de cortesía:
1."El transcriptoma de las células pluripotentes" por Grskovic, M. y Ramalho-Santos, M., The Pluripotent Transcriptome (10 de octubre de 2008), Stembook, Ed. The Stem Cell Research Community, Stembook, doi/10.3824/STEMBook.1.24.1, http: // www.libro de mora.organizar. - [1] Directstembook Figura 2 El transcriptoma de células pluripotentes.Grskovic, M. y Ramalho-Santos, M., The Pluripotent Transcriptome (10 de octubre de 2008), Stembook, Ed. The Stem Cell Research Community, Stembook, doi/10.3824/STEMBook.1.24.1, (CC por 3.0) a través de Commons Wikimedia