Diferencia entre genotipado y secuenciación

Diferencia clave: genotipado versus secuenciación
 

El genotipado y la secuenciación son dos técnicas realizadas para obtener información sobre los ácidos nucleicos, principalmente el ADN de un organismo. La diferencia clave entre el genotipado y la secuencia es que El genotipado es el proceso de determinar qué variante genética posee el individuo usando marcadores, mientras que la secuenciación es la determinación del orden correcto de la secuencia de nucleótidos dentro del fragmento dado de ADN.

CONTENIDO
1. Descripción general y diferencia de claves
2. ¿Qué es el genotipado?
3. ¿Qué es la secuenciación?
4. Comparación de lado a lado - Genotipado frente a secuenciación
5. Resumen

¿Qué es el genotipado??

El genotipado es la determinación de la composición genética de un individuo usando una secuencia de ADN y marcadores e comparación e identificación de su herencia. El genotipado es importante en biología evolutiva, biología de la población, taxonomía, ecología y genética de los organismos. Se puede realizar mediante diferentes técnicas que incluyen secuenciación de ADN, reacción en cadena de la polimerasa, polimorfismo de longitud de fragmento de restricción (RFLP), detección polimórfica amplificada aleatoria, polimorfismo de longitud de fragmento amplificado (AFLP), microarrays de ADN, etc.

El genotipado implica la secuenciación de pequeños fragmentos particulares de secuencias de ADN y el hallazgo de la relación de la composición genética con otros individuos que usan marcadores genéticos. Determina los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) entre los individuos o los alelos específicos. El genotipado es aplicable a una amplia gama de organismos, incluidos los humanos. También es aplicable a microorganismos como virus, hongos, etc. y se puede usar para determinar sus variantes genéticas con los perfiles de referencia. En la epidemiología molecular y la microbiología forense, el control de los patógenos, especialmente los microorganismos, se realiza mediante la información obtenida del genotipado. El genotipado es muy importante en el análisis de pedigrí. Los humanos son genotipados para confirmar la maternidad y la paternidad. El genotipo revelará los alelos dominantes y recesivos de los genes que deciden rasgos específicos.

Figura_1: genotipado RFLP

¿Qué es la secuenciación??

La secuenciación es el proceso de determinar el orden correcto del nucleótido en un fragmento dado de ADN o ARN. Prácticamente toda la información requerida para el crecimiento y el desarrollo de un organismo está codificada en su genoma. La disponibilidad de técnicas para producir y separar unos pocos cientos de nucleótidos de fragmentos de ácidos nucleicos largos condujo al desarrollo de procedimientos para determinar la secuencia exacta de nucleótidos de un fragmento dado de ADN o ARN.  Diferentes tipos de métodos de secuenciación están disponibles hoy en día. Estos métodos de secuenciación, junto con las tecnologías para la construcción de bibliotecas del genoma que representan todo el genoma de un organismo, facilitan la secuenciación de todo el genoma de ese organismo, haciendo un análisis en profundidad de estructuras génicas, funciones génicas, ubicaciones de genes, expresiones genéticas, Mapeo génico, regiones reguladoras de genes, etc.

Los genomas totales de muchos virus, varias bacterias, arquebacterias, levadura y varios otros organismos han sido secuenciados y mapeados. El proyecto del genoma humano ha hecho posible secuenciar y asignar todo el genoma humano y publicar su primer borrador en 2003. Es un hito importante en el avance de la biología. Las secuencias del genoma humano ahora se usan en el sector médico para identificar causas genéticas de enfermedades raras, riesgo de enfermedad en los recién nacidos, identificar detalles genéticos de diferentes cánceres, desarrollar nuevas terapias y desarrollar nuevas herramientas de diagnóstico, etc.

En el mundo de las plantas, el genoma del arroz y los genomas de Arabidopsis han sido secuenciados. El conocimiento de estas secuencias sin duda revolucionará nuestra comprensión de cómo funcionan las células y los organismos.

Figura_2: un autorradiógrafo de secuenciación de Sanger

¿Cuál es la diferencia entre genotipado y secuenciación??

Resumen -Genotipado versus secuenciación

El genotipado y la secuenciación son útiles para estudiar la información genética de los organismos. El genotipado es el proceso de determinar las variaciones del genotipo entre los individuos y encontrar sus categorías. La secuenciación es el proceso de determinar el orden correcto de los nucleótidos en el fragmento interesado o la región de ADN. Ambas técnicas proporcionan información importante sobre los genes y los genomas.

Referencia:
1. "Métodos de genotipado."Métodos en biología molecular (Clifton, N.J.). U.S. Biblioteca Nacional de Medicina, N.d. Web. 20 de febrero. 2017.
2. AKEY, J. METRO., D. Sosnoski, E. Parra, S. Dioses, K. Heister, B. Su, C. Bonilla, L. Jin y M. D. Cavador. "Análisis de la curva de fusión de SNP (MCSNP ): un enfoque sin gel y económico para el genotipado de SNP.Biotechniques 30.2 (2001): 358-67. Web.

Imagen de cortesía:
1. "Genotipado RFLP" por (desconocido) - Institutos Nacionales de Salud (dominio público) a través de Commons Wikimedia
2. "Radioactivo fluorescente" de Abizar en English Wikipedia (CC By-SA 3.0) a través de Commons Wikimedia