Diferencia entre homología y similitud en bioinformática
El diferencia clave Entre la homología y la similitud en la bioinformática es que La homología se refiere a una declaración sobre ascendencia evolutiva común de dos secuencias, mientras que la similitud se refiere al grado de semejanza entre dos secuencias.
La bioinformática es un campo de la ciencia que combina biología, ingeniería de la información, informática, matemáticas y estadísticas para analizar e interpretar datos biológicos. La homología y la similitud son dos términos que utilizamos en el campo de la bioinformática. Podemos calcular fácilmente la similitud como porcentaje de residuos similares en una longitud dada de la alineación. Sin embargo, no podemos calcular la homología, ya que podría ser verdadero o falso y generalmente depender de la hipótesis utilizada.
CONTENIDO
1. Descripción general y diferencia de claves
2. ¿Qué es la homología en bioinformática?
3. ¿Qué es la similitud en la bioinformática?
4. Similitudes entre homología y similitud en bioinformática
5. Comparación de lado a lado -Homología versus similitud en bioinformática en forma tabular
6. Resumen
¿Qué es la homología en bioinformática??
La homología en bioinformática se refiere a la homología biológica entre el ADN, el ARN y las secuencias de proteínas que se definen en términos de propiedades ancestrales compartidas en el árbol evolutivo de la vida. En otras palabras, es la ascendencia evolutiva común de dos secuencias. La razón de tal ocurrencia podría deberse a eventos de especiación (ortólogos), eventos de transferencia de genes horizontales (xenologs) o eventos de duplicación (parálogos).
Figura 01: Alineación de secuencias múltiples
Es posible deducir la homología entre el ADN, el ARN o las proteínas por su aminoácido o la secuencia de nucleótidos Similitud. Una similitud significativa sirve como una propiedad probatoria fuerte para inferir que dos secuencias están relacionadas con una secuencia ancestral común con cambios evolutivos. Las alineaciones de secuencias múltiples indican las regiones de cada secuencia con naturaleza homóloga.
¿Qué es la similitud en la bioinformática??
En bioinformática, la similitud evalúa la similitud entre dos proteínas o secuencias de nucleótidos. Hay dos pasos principales para este proceso. El paso inicial es la alineación de pares, lo que ayuda a encontrar la alineación óptima entre dos secuencias (incluidas las brechas) usando algoritmos como BLAST, FASTA y Lalign. Después de la alineación por pares, es necesario obtener dos parámetros cuantitativos de cada comparación de pares. Son identidad y similitud. En explosión, las similitudes de búsqueda se conocen como positivas.
Figura 02: Alineación por pares
Una mutación conservadora ocurre cuando un aminoácido muta a un residuo similar al tiempo que preserva las propiedades fisioquímicas. Por ejemplo, si la arginina muta a la lisina con una carga positiva +1, se acepta ya que los dos aminoácidos son similares en propiedad y no cambian la proteína traducida. Por lo tanto, las mediciones de similitud dependen de los criterios de cómo son dos residuos de aminoácidos entre sí.
¿Cuáles son las similitudes entre la homología y la similitud en la bioinformática??
- La homología y la similitud son dos términos técnicos que encontramos en bioinformática.
- Además, ambos términos se refieren al análisis molecular de secuencias.
¿Cuál es la diferencia entre homología y similitud en bioinformática??
La homología se refiere a una declaración sobre ascendencia evolutiva común de dos secuencias, mientras que la similitud se refiere al grado de semejanza entre dos secuencias. Entonces, esta es la diferencia clave entre la homología y la similitud en la bioinformática. Además, la homología no se puede calcular, ya que podría ser verdadero o falso y generalmente depende de la hipótesis, mientras que la similitud se puede calcular fácilmente como un porcentaje de residuos similares durante una longitud dada de la alineación. Por lo tanto, esta es una diferencia significativa entre la homología y la similitud en la bioinformática.
La siguiente infografía enumera la diferencia entre homología y similitud en bioinformática.
Resumen -Homología versus similitud en bioinformática
En resumen, la diferencia clave entre la homología y la similitud en la bioinformática radica en sus definiciones. La homología es una declaración de ascendencia evolutiva común de dos secuencias, mientras que la similitud es la semejanza entre dos secuencias. La homología ocurre debido a ortólogos, parálogos y xenologs. Al deducir la similitud, es posible usar algoritmos como FASTA, Blast y Lalign. La homología no puede expresarse como un cálculo, pero la similitud podría expresarse como un porcentaje de residuos similares durante una longitud dada de la alineación. Por lo tanto, este es el resumen de la diferencia entre la homología y la similitud en la bioinformática.
Referencia:
1."Homólogo."Homólogo - Bioinformática.Org Wiki, disponible aquí.
2. "Identidad y similitud: una medida cuantitativa."Identidad y similitud: una medida cuantitativa, disponible aquí.
Imagen de cortesía:
1. "Un extracto de una alineación de secuencia múltiple de las proteínas TMEM66" por Wikid25 - CLUSTALW de código abierto y secuencias de la base de datos pública de proteínas NCBI (CC0) a través de Wikimedia Commons
2. "Alineación global por pares" por Alfat003 - Trabajo propio (CC BY -SA 4.0) a través de Commons Wikimedia
