Diferencia entre metagenómica y metatranscriptómica
El diferencia clave Entre la metagenómica y la metatranscriptómica se basa en el tipo de biomoléculas estudiadas en cada área. La metagenómica estudia el ADN, sus secuencias y su comportamiento en los organismos, mientras que la metatranscriptómica estudia el ADN transcrito, principalmente secuencias de ARNm y su comportamiento en los organismos.
La metagenómica y la metatranscriptómica son dos campos que han ganado mucha popularidad a lo largo de los años en relación con la comunidad microbiana. Son importantes en la atención médica, la industria y la biotecnología agrícola. Tanto la metagenómica como la metatranscriptómica permiten el estudio de organismos individuales en una comunidad y sus roles funcionales que son beneficiosos o dañinos.
CONTENIDO
1. Descripción general y diferencia de claves
2. ¿Qué es la metagenómica?
3. ¿Qué es la metatranscriptómica?
4. Similitudes entre metagenómica y metatranscriptómica
5. Comparación de lado a lado: metagenómica vs metatranscriptómica en forma tabular
6. Resumen
¿Qué es la metagenómica??
La metagenómica es el campo de estudio que explora el ácido desoxirribonucleico (ADN). Es más relevante para la comunidad microbiana. Además, es un campo más avanzado en comparación con la genómica. En genómica, se produce el análisis de un ADN de organismos en particular. Sin embargo, la metagenómica implica el análisis del material genético en una comunidad de organismos. Por lo tanto, esto permite estudiar el comportamiento de una comunidad de organismos relacionados con una condición o un entorno.
Figura 01: Metagenómica
La principal técnica involucrada en los estudios de metagenómica es la secuenciación de la próxima generación (NGS) que utiliza la tecnología de micro-matar. Los métodos NGS pueden analizar múltiples organismos en una sola reacción para la presencia o ausencia de secuencias de ADN específicas. Estas secuencias de ADN pueden ser responsables de una sola enfermedad o una condición ambiental. Por lo tanto, utilizando el conocimiento metagenómico, la detección de los organismos se puede hacer de manera fácil y precisa. La secuencia durante NGS tiene lugar en lecturas cortas y el perfil del ADN de los organismos tiene lugar. La secuencia de ADN 16S es una secuencia popular estudiada en metagenómica sobre microorganismos.
Después de la secuenciación de la comunidad de organismos, se debe hacer la alineación de las secuencias. Herramientas como la herramienta básica de secuencia de alineación local (BLAST) están en uso para cumplir con la tarea de alineación. Después de la alineación, un árbol filogenético proporciona la relación de cada organismo en la comunidad y los detalles sobre su comportamiento.
¿Qué es la metatranscriptómica??
La metatranscriptómica es el campo de estudio que trata el transcriptoma de un organismo. El transcriptoma constituye todas las secuencias de ARN transcritas durante la transcripción de ADN. Las secuencias de ARNm presentes en el transcriptoma proporcionan información sobre la expresión genética. La metatranscriptómica es el análisis de múltiples transcriptomas entre poblaciones o comunidades.
Figura 02: Análisis de transcriptoma
Los estudios de metatranscriptómica también utilizan tecnologías de microarrays para encontrar las secuencias de las secuencias de lectura corta. Además, la metatranscriptómica también implica un análisis bioinformático completo utilizando herramientas de alineación y métodos de diseño de árboles. Sin embargo, el campo de la metatranscriptómica es mucho más difícil en comparación con la metagenómica. La extracción de ARNm o ARN en su conjunto no es tan fácil como parece ser. Dado que el ARN es muy propenso a la destrucción y tiene un tiempo de vida muy corto, el mantenimiento y el almacenamiento de estos podrían ser una posible consulta.
¿Cuáles son las similitudes entre metagenómica y metatranscriptómica??
- La metagenómica y la metatranscriptómica son técnicas de alto rendimiento para analizar comunidades de organismos, principalmente comunidades microbianas.
- Ambas técnicas utilizan la tecnología de microarrays para deducir los hallazgos.
- Los resultados obtenidos a menudo se analizan utilizando la alineación de la explosión y los árboles filogenéticos.
- Además, ambas técnicas no se centran en un organismo, sino en un grupo o organismos comunitarios.
- Además, ambos conceptos también se estudian principalmente en relación con los microbios, la razón principal es que se desempeñan sus diversos roles.
¿Cuál es la diferencia entre metagenómica y metatranscriptómica??
La metagenómica y la metatranscriptómica implican el análisis de la materia genética en una comunidad de organismos. Por lo tanto, la metagenómica se refiere a los patrones y secuencias de ADN, mientras que la metatranscriptómica se refiere al análisis del ARNm o el ADN transcrito. Entonces, esta es la diferencia clave entre metagenómica y metatranscriptómica.
Además, el procedimiento de extracción difiere en ambas técnicas; La metagenómica involucra procedimientos de extracción de ADN y metatranscriptómica involucra procedimientos de extracción de ARN. Por lo tanto, esta también es una diferencia significativa entre la metagenómica y la metatranscriptómica.
La siguiente infografía resume la diferencia entre metagenómica y metatranscriptómica:
Resumen -Metagenómica vs Metatranscriptomics
La metagenómica y la metatranscriptómica son nuevos campos de estudio que analizan una comunidad de organismos para una condición particular. Por lo tanto, la metagenómica se refiere al análisis de secuencias de ADN. En contraste, la metatranscriptómica se refiere al análisis de secuencias de ARN o productos de ADN transcritos. En este sentido, la metatranscriptómica permite la identificación de la expresión génica para un caso particular. Ambos son importantes para analizar mutaciones y sus efectos. Estas son técnicas rápidas y más confiables utilizadas en diagnóstico anticipado. Por lo tanto, este es el resumen de la diferencia entre metagenómica y metatranscriptómica.
Referencia:
1. Aguiar-Pulido, Vanessa, et al. “Enfoques de metagenómica, metatranscriptómica y metabolómica para el análisis de microbioma."Evolutionary Bioinformatics Online, Libertasacademica, 12 de mayo de 2016, disponible aquí.
Imagen de cortesía:
1. "PCBI.1002808.G001 "por figuras de filogenia (CC por 2.0) a través de Flickr
2. "Transcriptome Fig 3" de Danny556 (charla)-Hecho a sí mismo (C By-SA 3.0) a través de Flickr
