Diferencia entre el acoplamiento molecular y la puntuación
El diferencia clave Entre el acoplamiento molecular y la puntuación es que El acoplamiento es una técnica utilizada para determinar la afinidad de unión entre dos moléculas, mientras que la puntuación es un proceso de evaluación de una pose particular contando el número de interacciones intermoleculares favorables.
Los términos acoplamiento y puntuación moleculares se utilizan en el campo del modelado molecular. El modelado molecular es una técnica utilizada para determinar las posibles arreglos de diferentes moléculas en una sustancia dada. Esta técnica es importante para crear nuevos compuestos estables.
CONTENIDO
1. Descripción general y diferencia de claves
2. ¿Qué es el acoplamiento molecular?
3. ¿Qué es la puntuación molecular?
4. Comparación de lado a lado: acoplamiento molecular frente a la puntuación en forma tabular
5. Resumen
¿Qué es el acoplamiento molecular??
El acoplamiento molecular es una simulación computacional de un ligando candidato que se une a un receptor. Este método predice la orientación preferida de una molécula a otra molécula cuando se unen entre sí para formar un complejo estable. Los resultados obtenidos de esta técnica pueden usarse para predecir la resistencia de asociación o afinidad de unión entre dos moléculas. Aquí, la función de puntuación molecular también es importante.
Figura 01: Un diagrama simple que muestra el proceso de interacciones moleculares en sistemas biológicos
En general, esta técnica considera las moléculas biológicamente relevantes, como proteínas, péptidos, ácidos nucleicos, carbohidratos y lípidos. Estas moléculas son muy importantes y juegan un papel importante en los mecanismos de transducción de señales en nuestro cuerpo. Por lo tanto, la orientación de las dos moléculas que se unirán para este proceso de transducción de señal afecta el tipo de señal producida aquí. Eso significa; El acoplamiento molecular es importante para determinar tanto la resistencia como el tipo de señal producida durante la transducción de señales en los sistemas biológicos.
Además, las técnicas de acoplamiento molecular son importantes para diseñar medicamentos basados en estructuras. Eso se debe a su previsibilidad de la conformación de unión de moléculas pequeñas como los ligandos a un sitio de unión adecuado.
¿Qué es la puntuación molecular??
La puntuación molecular es un tipo de función matemática que es útil para evaluar el progreso del acoplamiento molecular. En el campo de la química computacional, las funciones de puntuación se utilizan para predecir la afinidad de unión entre dos moléculas después del proceso de acoplamiento. Por ejemplo, si tenemos una molécula pequeña de un fármaco de partículas y hay un objetivo biológico como una proteína, podemos evaluar la afinidad del fármaco hacia el sitio de unión. Además, la puntuación molecular se puede utilizar para predecir las interacciones intermoleculares entre dos proteínas o entre una proteína y moléculas de ADN.
Figura 02: función de puntuación en breve
La principal aplicación de la puntuación molecular está en los procesos de diseño de fármacos, por ejemplo, detección virtual, diseño de novo, optimización de plomo, etc.
¿Cuál es la diferencia entre el acoplamiento molecular y la puntuación??
El acoplamiento y la puntuación moleculares son importantes en el modelado molecular. La diferencia clave entre el acoplamiento molecular y la puntuación es que el acoplamiento es una técnica utilizada para determinar la afinidad de unión entre dos moléculas, mientras que la puntuación es un proceso de evaluación de una pose particular al contar el número de interacciones intermoleculares favorables.
La siguiente infografía resume la diferencia entre el acoplamiento molecular y la puntuación.
Resumen -Docking molecular vs puntuación
El acoplamiento y la puntuación moleculares son importantes en el modelado molecular. La diferencia clave entre el acoplamiento molecular y la puntuación es que el acoplamiento es una técnica utilizada para determinar la afinidad de unión entre dos moléculas, mientras que la puntuación es un proceso de evaluación de una pose particular al contar el número de interacciones intermoleculares favorables.
Referencia:
1. "Aquipando (molecular)."Docking (Molecular) - Una descripción general | Temas de ciencias, disponibles aquí.
2. Dar, ayaz mahmood. "Moleque molecular: enfoques, tipos, aplicaciones y desafíos básicos."Omics International, Omics International, 27 Mar. 2017, disponible aquí.
Imagen de cortesía:
1. "Representación de Docking 2" de Scigenis - Trabajo propio (CC By -SA 4.0) a través de Commons Wikimedia
2. "Pastor de puntuación" de Poulamibman en English Wikibooks - Transferido desde EN.Wikibooks to Commons de Adrignola utilizando Commonshelper (dominio público) a través de Commons Wikimedia
