Diferencia entre la secuenciación de nanoporos e ilumina

El diferencia clave Entre la secuencia de nanoporo e ilumina Es que la secuenciación de nanoporos es una técnica de secuenciación de tercera generación que utiliza un nanoporo para detectar la secuencia de una molécula de ADN, mientras que la secuenciación de Illumina es una técnica de secuenciación de segunda generación que utiliza tecnología de terminadores de colorantes reversibles para detectar la secuencia de una molécula de ADN una molécula de ADN.

La secuenciación de ADN es la determinación de un nucleótido preciso o secuencia base de una molécula de ADN. Existen muchos métodos rápidos para determinar secuencias de ácido nucleico que aceleran los descubrimientos de investigación biológica y médica. Frederick Sanger desarrolló una de las primeras técnicas de secuenciación de ADN (Sanger Secencing) adoptando la estrategia de extensión de cebadores en el Centro MRC, Cambridge, Reino Unido. Hoy, la mayoría de las técnicas de secuenciación rápida de ADN pertenecen a categorías de secuenciación de ADN de segunda generación (próxima generación) y de tercera generación. La secuenciación de nanoporo e ilumina son dos tecnologías de ADN nuevas.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia de claves
2. ¿Qué es la secuenciación de nanoporos?
3. ¿Qué es la secuenciación de Illumina?
4. Similitudes: secuenciación de nanoporo e ilumina
5. Nanopore vs ilumina secuenciación en forma tabular
6. Resumen - Nanopore vs ilumina secuenciación

¿Qué es la secuenciación de nanoporos??

La secuenciación de nanopore es una técnica de secuenciación de tercera generación que utiliza un nanoporo de proteína para detectar la secuencia de ácido nucleico de una molécula de ADN. En la secuenciación de nanoporos, el ADN que pasa a través del nanoporo cambia su corriente. Este cambio depende de la forma, el tamaño y la longitud de la secuencia de ADN. La señal resultante se decodifica para obtener la secuencia específica de ADN o ARN. Este método no requiere nucleótidos modificados, y funciona en tiempo real.

Figura 01: secuenciación de nanoporos

Oxford Nanopore Technologies es una empresa popular que fabrica numerosos dispositivos de secuenciación de nanoporos. La mayoría de los dispositivos de secuenciación de nanoporos de Oxford tienen células de flujo. Esta celda de flujo tiene una serie de pequeños nanoporos que están integrados en la membrana electro resistente. Cada nanopore corresponde a su propio electrodo. Este electrodo se conecta a un canal y un chip de sensor. Este electrodo mide la corriente eléctrica que fluye a través del nanopore. Cuando una molécula pasa a través de un nanoporo, su corriente cambia o se interrumpe. Además, esta interrupción produce un colapso característico. Este recortes se decodifica para determinar la secuencia de ADN o ARN en tiempo real.

¿Qué es la secuenciación de Illumina??

La secuenciación de Illumina es una técnica de secuenciación de segunda generación que utiliza tecnología de terminadores de tinte reversible para detectar la secuencia de moléculas de ADN. Solexa Company, ahora parte de Illumina Company, fue fundada en 1998.  Esta compañía inventó este método de secuenciación basado en tecnología de terminadores de tinte reversible y polimerasas diseñadas.

Figura 02: secuenciación de Illumina

En el método de secuenciación de Illumina, la muestra se escinde primero en secciones cortas.  Por lo tanto, en la secuenciación de Illumina, se crean lecturas cortas o fragmentos de 100-150 pb o fragmentos al principio. Estos fragmentos se ligan a adaptadores genéricos y se recocen a una diapositiva. La PCR se realiza para amplificar cada fragmento. Esto crea un lugar con muchas copias del mismo fragmento. Más tarde, se separan en cadena única y se someten a secuenciación.  El portaobjetos de secuenciación contiene nucleótidos marcados con fluorescencia, ADN polimerasa y un terminador. Debido al terminador, solo se agrega una base a la vez. Cada terminador de ciclo se elimina y permite la adición de la siguiente base al sitio. Además, según las señales fluorescentes, la computadora detecta la base agregada en cada ciclo. La tecnología de secuenciación de Illumina construye la secuencia en 4 a 56 horas.

¿Cuáles son las similitudes entre la secuenciación de nanoporo e ilumina??

• La secuenciación de nanoporo e ilumina son dos técnicas de secuenciación.
• Ambos son métodos de secuenciación rápidos y nuevos.
• Se utilizan para detectar secuencias de ADN y ARN.
• Ambos tienen alta precisión.

¿Cuál es la diferencia entre la secuenciación de nanoporo e ilumina??

La secuenciación de nanopore es una técnica de secuenciación de tercera generación que utiliza un nanoporo para detectar la secuencia de moléculas de ADN. En contraste, la secuenciación de Illumina es una técnica de secuenciación de segunda generación que utiliza tecnología de terminadores de tinte reversible para detectar la secuencia de moléculas de ADN. o, esta es la diferencia clave entre la secuenciación de nanoporos e ilumina. Además, la secuenciación de nanoporos tiene una precisión del 92-97%, mientras que la secuenciación de Illumina tiene una precisión del 99%.

La siguiente infografía enumera las diferencias entre la secuenciación de nanoporo e ilumina en forma tabular.

Resumen -Nanopore vs ilumina secuenciación

Las técnicas de secuenciación de alto rendimiento incluyen métodos de secuenciación de segunda generación (lectura corta) y de tercera generación (lectura larga). La secuenciación de Nanopore e Illumina son dos nuevas tecnologías de ADN que pertenecen a categorías de secuenciación de ADN de tercera generación y segunda generación (próxima generación). La secuenciación de nanoporo utiliza un nanoporo para detectar la secuencia de moléculas de ADN. Por otro lado, la secuenciación de Illumina utiliza tecnología de terminadores de tinte reversible para detectar la secuencia de moléculas de ADN. Por lo tanto, este es el resumen de la diferencia entre la secuenciación de nanoporo e ilumina.

Referencia:

1. "Secuencia ADN."Oxford Nanopore Technologies.
2. "Secuenciación de tinte de Illumina."Una descripción general | Temas de ciencias.

Imagen de cortesía:

1. "Oxford Nanopore Minion Flow Cell Back" de Cirosantilli2 - Trabajo propio (CC BY -SA 4.0) a través de Commons Wikimedia
2. "Illumina Miseq Sequencer" de Konrad Förstner - Trabajo propio (CC0) a través de Commons Wikimedia