Diferencia entre NGS y WGS

Diferencia entre NGS y WGS

El diferencia clave entre NGS y WGS Es que la secuenciación de próxima generación (NGS) es una tecnología de secuenciación de segunda generación masivamente paralela que es de alto rendimiento, bajo costo y rápido, mientras que la secuenciación de genoma completo (WGS) es un método integral para analizar todo el ADN genómico de un celular de un celular En un solo momento utilizando técnicas de secuenciación como la secuenciación de Sanger, el enfoque de escopeta o la secuenciación de NGS de alto rendimiento.

En las últimas décadas, la comprensión del genoma de los humanos y otros animales ha aumentado enormemente debido al descubrimiento de técnicas de secuenciación rápida y herramientas bioinformáticas. Las técnicas de secuenciación convencionales, como la secuenciación de Sanger, tenían sus limitaciones, lo que requería el desarrollo de nuevos métodos de secuenciación rápida, como la secuenciación de próxima generación (NGS) y la secuenciación de nanoporos. La técnica de secuenciación de genoma completo (WGS) es un enfoque reciente que ya se utiliza en muchos proyectos de investigación genómica, como 100,000 proyectos genómicos de Genomic England, Reino Unido. Entonces, NGS y WGS son dos métodos de secuenciación que actualmente se están incorporando en muchos proyectos genómicos.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia de claves
2. Que es NGS 
3. ¿Qué es WGS?
4. Similitudes - ngs y wgs
5. NGS vs WGS en forma tabular
6. Resumen - NGS vs WGS

Que es NGS?

NGS (secuenciación de próxima generación) es una tecnología de secuenciación de segunda generación masivamente paralela que es de alto rendimiento, bajo costo y rápido. No hay una definición precisa para la secuenciación de próxima generación. Pero podemos distinguirlo claramente de las técnicas de secuenciación basadas en capilares convencionales. La secuenciación de próxima generación permite la secuenciación de una molécula de ADN con un tamaño total mayor de 1 millón de pares de bases en un solo experimento. Ofrece opciones de velocidad y alto rendimiento sin precedentes, como permitir la secuenciación del ADN de múltiples individuos al mismo tiempo. Esto se logra miniaturizando el volumen de reacciones de secuenciación individuales. Además, esto también limita el tamaño de los instrumentos y minimiza el costo de los reactivos por reacción.

Figura 01: plataformas NGS

NGS es un método de secuenciación de lectura corta que ya ha revolucionado el campo de investigación biológica. Además, NGS se aplica en varias áreas como la secuenciación del genoma de novo, la secuenciación de genoma completo, el análisis de transcriptoma, la secuenciación de ARN y micro de micro, la resequenciación dirigida y la secuenciación de exoma completo.

¿Qué es WGS??

WGS (secuenciación de genoma completo) es un método integral para analizar todo el ADN genómico de una célula en un solo momento utilizando técnicas de secuenciación como la secuenciación de Sanger, el enfoque de escopeta o la secuenciación de NGS de alto rendimiento. También se conoce como secuenciación del genoma completo o secuenciación del genoma completo. La secuenciación del genoma completo implica la secuenciación de todo el ADN cromosómico de un organismo, así como el ADN en las mitocondrias, y para las plantas, el ADN en el cloroplasto en un solo tiempo. WGS permite a los científicos leer la secuencia exacta de todas las letras que componen el conjunto completo de ADN. Se espera que WGS que usan la plataforma NGS revolucione la configuración clínica.

Figura 02: WGS vs secuenciación de escopeta jerárquica

La secuenciación de genoma completo se introdujo en la atención clínica en 2014. Además, la aplicación de WGS implica la secuenciación de genes a nivel de SNP para identificar variantes funcionales en estudios de asociación, intervención terapéutica en medicina personalizada, biología evolutiva, análisis genómico comparativo, mutaciones y estudios de reordenamiento, estudios de asociación de variantes raros e predicción de la susceptibilidad de la enfermedad y la susceptibilidad de la enfermedad y el fármaco respuesta.

¿Cuáles son las similitudes entre NGS y WGS??

  • NGS y WGS son dos técnicas de secuenciación.
  • Ambas técnicas de secuencia ADN o ARN.
  • Estas técnicas son nuevas y confiables.
  • Ambos se usan para diagnosticar enfermedades y descubrimiento de medicamentos.

¿Cuál es la diferencia entre NGS y WGS??

NGS es una tecnología de secuenciación de segunda generación masivamente paralela que es de alto rendimiento, bajo costo y rápido, mientras que WGS es un método integral para analizar todo el ADN genómico de una célula en un solo tiempo utilizando técnicas de secuenciación como secuenciación sanger, escotera enfoque o secuenciación NGS de alto rendimiento. Entonces, esta es la diferencia clave entre NGS y WGS. Además, NGS consiste en solo métodos de secuenciación de segunda generación, mientras que WGS consiste en métodos de secuenciación de primera, segunda y tercera generación.

La siguiente tabla presenta las diferencias entre y ngs y wgs en forma tabular para la comparación de lado a lado.

Resumen -NGS vs WGS

En las últimas décadas, diferentes técnicas de secuenciación se han aplicado rutinariamente en la investigación molecular contemporánea. E incluso son herramientas muy poderosas para muchas aplicaciones clínicas. NGS y WGS son dos métodos de secuenciación que actualmente se están incorporando en muchos proyectos genómicos.   NGS es una tecnología de secuenciación de segunda generación que es de alto rendimiento, bajo costo y rápido. Por otro lado, WGS es un método para analizar todo el ADN genómico o el ADN genómico completo de una célula en un solo momento utilizando técnicas de secuenciación como la secuenciación de Sanger, el enfoque de escopeta o la secuenciación de NGS de alto rendimiento. Entonces, este es el resumen de la diferencia entre NGS y WGS.

Referencia:

1. Behjati, Sam y Patrick S Tarpey. "¿Qué es la secuenciación de la próxima generación??"Archivos de la enfermedad en la infancia. Edición de educación y práctica, BMJ Publishing Group.
2. "Se secuenciación del genoma completo."Una descripción general | Temas de ciencias.

Imagen de cortesía:

1. "Secuenciación de 2da generación" de Chandra Shekhar Pareek, Rafal Smoczynski y Andrzej TreTyn - Journal of Applied Genetics - Volumen 52 - Número 4 (CC By -SA 3.0) a través de Commons Wikimedia
2. "Secuenciación de escopeta de genoma completo versus secuenciación de escopeta jerárquica" de Commins, J., Toft, c., Tarifas, m. A. - "Métodos de biología computacional y su aplicación a la genómica comparativa de las bacterias simbióticas endocelulares de los insectos" Biol. Procedimientos en línea (2009). Accedido a través de SpringerImages. (CC BY-SA 2.5) Vía Commons Wikimedia