Diferencia entre la sonda y el imprimador
Diferencia de clave: sonda vs imprimador
La sonda molecular es un pequeño fragmento de ADN o ARN que reconoce las secuencias complementarias en ADN o ARN y permite la identificación de la secuencia objetivo. La imprimación es un pequeño tramo de ADN o ARN que sirve como punto de partida para la síntesis de ADN. Cebadores y sondas Hibridarse con los nucleótidos complementarios del ADN de la plantilla o el ADN objetivo. Sin embargo, la diferencia clave entre la sonda y el imprimador es que Los cebadores son necesarios para la replicación del ADN, mientras que las sondas son necesarias para la detección de secuencias específicas en el ADN de la muestra.
CONTENIDO
1. Descripción general y diferencia de claves
2. Que es la sonda
3. Que es la imprimación
4. Comparación de lado a lado - sonda vs imprimación
5. Resumen
Que es una sonda?
La sonda es un pequeño fragmento de ADN o ARN utilizado para detectar el ADN o ARN objetivo en la muestra por hibridación molecular. También se conocen como marcadores moleculares. La longitud de la sonda puede variar (100 a 1000 bases), y los nucleótidos de la sonda son complementarios a la parte de la secuencia objetivo. Para la facilidad de detección, las sondas están marcadas con isótopos radiactivos o con colorantes o anticuerpos fluorescentes. Las sondas se unen con las bases complementarias de la secuencia objetivo y revelan la presencia del ADN o ARN objetivo en la muestra. Hay dos métodos principales de etiquetado de las sondas: Etiquetado final y traducción de Nick. Las sondas se clasifican en diferentes tipos que incluyen sondas de ADN, sondas de ARN, sondas de ADNc y sondas de oligonucleótidos sintéticos, y se preparan utilizando diferentes técnicas.
Las sondas son herramientas importantes en muchas áreas microbianas y moleculares como virología, patología forense, pruebas de paternidad, huellas dactilares de ADN, detección de enfermedades genéticas, RFLP, citogenética molecular, en el lugar hibridación, etc.
Figura 01: sonda marcada con fluorescencia utilizada en peces para la detección de patógenos
Que es una imprimación?
El cebador es un fragmento de ADN o ARN corto que sirve como iniciador para la síntesis de ADN. La enzima de ADN polimerasa agrega nucleótidos al grupo 3 'OH de secuencia de cebadores y sintetiza el nuevo hilo complementario al ADN de la plantilla. Los cebadores son fragmentos muy cortos con la longitud de 18 a 20 nucleótidos. Se sintetizan químicamente en el laboratorio para in vitro Amplificación de ADN (PCR). Los cebadores pueden tener cualquier secuencia de nucleótidos ya que están diseñados por el usuario. Se sintetizan para que coincidan con las bases complementarias de la plantilla ADN. Por lo tanto, puede tener cualquier secuencia de nucleótidos. Los cebadores son de suma importancia para la replicación del ADN, ya que la ADN polimerasa no puede sintetizar un nuevo ADN sin una pieza de ADN preexistente. Al diseñar los cebadores para PCR, se deben considerar las siguientes cosas:
- Los cebadores deben contener los nucleótidos complementarios al extremo flanqueante del ADN que quiere amplificar.
- Los cebadores deben tener una temperatura de fusión entre 55 y 65 0C
- El contenido de G y C debe estar entre 50 y 60%.
Se usan dos cebadores en PCR como avance y reverso para replicar ambos hilos del ADN de la muestra. Los cebadores se usan comúnmente para realizar la secuenciación de PCR y ADN.
Figura 02: Recocido de imprimación en PCR
¿Cuál es la diferencia entre sonda y imprimación??
Sonda vs imprimador | |
| La sonda es un pequeño fragmento de ADN/ARN utilizado para detectar la presencia de la secuencia objetivo en una muestra por hibridación molecular. | La imprimación es un pequeño tramo de ADN o ARN que sirve como punto de partida para la replicación del ADN. |
| Función | |
| Esto detecta la presencia de una secuencia específica en la muestra de ADN o ARN. | Esto actúa como un punto de partida para la síntesis de ADN. |
| Longitud | |
| La longitud puede estar en el rango de 100 - 1000 bases | La longitud es generalmente de entre 18 y 20 bases |
| Unión con secuencia complementaria | |
| La sonda hibrida con las bases complementarias de la secuencia objetivo | Recoces de imprimación con las bases complementarias de los hilos de ADN. |
| Etiquetado | |
| Las sondas están etiquetadas para facilitar la detección | Los cebadores generalmente no están etiquetados |
| Uso en PCR | |
| Las sondas no se usan en PCR | Los cebadores se usan en PCR |
Resumen - sonda vs imprimación
La sonda es un pequeño fragmento de secuencia de ADN o ARN que se puede hibridar con nucleótidos complementarios para detectar una secuencia objetivo en la muestra. Las sondas se etiquetan por radioactiva, inmunológica o fluorescente para ver la presencia de secuencia objetivo. El imprimador es un fragmento de ADN o ARN muy pequeño que actúa como punto de partida para in vitro Amplificación de ADN. La ADN polimerasa identifica el cebador de grupo 3 'OH e inicia la construcción de una nueva hebra complementaria a la plantilla. Las sondas y los cebadores funcionan de manera similar hibridando con nucleótidos complementarios. Por lo tanto, la diferencia clave entre la sonda y el cebador es su función principal.
Referencia:
1.Primer (biología molecular)."Wikipedia. Fundación Wikimedia, 02 de febrero. 2017. Web. 01 mar. 2017.
2."Sonda de hibridación."Wikipedia. Fundación Wikimedia, 30 de diciembre. 2016. Web. 01 mar. 2017
3.Primer (biología molecular).Realizador (Molecular Biology) - Temas de ciencias de las ciencias. norte.pag., norte.d. Web. 01 mar. 2017
Imagen de cortesía:
1. "Pescado para identificación de patógenos bacterianos" por Pepetps Togopic Ivan Akira Magnus Mansketimothy W. Ford -(CC BY -SA 3.0) a través de Commons Wikimedia
2. "Primers RevComp Melted2" de Richard Wheeler (Zephyris) - Trabajo propio (CC By -SA 3.0) a través de Commons Wikimedia
