Diferencia entre proteómica y transcriptómica

Diferencia clave: proteómica VS Transcriptomics
 

La tecnología OMIC es una tendencia actual, donde las diferentes biomoléculas de un organismo se consideran como una colección completa con respecto a sus propiedades y funciones. La tecnología Omic tiene una amplia gama de aplicaciones. Las diferentes ómicas de una muestra biológica incluyen genómica, proteómica, transcriptómica y metabolómica. La proteómica implica el estudio completo de todas las proteínas en un organismo vivo. Se define como el conjunto de todas las proteínas expresadas en un organismo, sus propiedades estructurales y funcionales. El conjunto completo de proteínas, por lo tanto, forman el proteoma. La transcriptómica es el estudio completo de todas las moléculas de ARN mensajero (ARNm) presentes en un organismo vivo. Por lo tanto, la transcriptómica trata con los genes que se expresan activamente en un organismo vivo. El conjunto total de ARNm en un organismo vivo se conoce como el transcriptoma. El diferencia clave entre proteómica y transcriptómica se basa en el tipo de biomolécula. En proteómica, se estudia el conjunto total de proteínas expresadas en un organismo vivo, mientras que, en transcriptómica, se estudia el ARNm total de un organismo vivo.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia de claves
2. ¿Qué es la proteómica?
3. ¿Qué es la transcriptómica?
4. Similitudes entre proteómica y transcriptómica
5. Comparación de lado a lado: proteómica vs transcriptómica en forma tabular
6. Resumen

¿Qué es la proteómica??

El término proteómica se acuñó en el año 1995 y se definió inicialmente como el complemento de proteína total en una célula, tejido o organismo. Con el avance en estudios proteómicos, se modificó para ser considerado como un término general en el que se incluyeron muchos campos de estudio. Actualmente, bajo el tema Proteómica, la estructura, la orientación, las funciones, sus interacciones, sus modificaciones, sus aplicaciones y la importancia de las proteínas se estudian. Por lo tanto, se realiza mucha investigación en el campo de la proteómica en la actualidad.

Se realizaron los primeros estudios proteómicos para identificar el contenido de proteínas en Escherichia coli. El mapeo del contenido total de proteínas se realizó utilizando geles bidimensionales (2D). Sobre el éxito de esto, los científicos continuaron caracterizando el contenido total de proteínas en animales como conejillos de indias y ratones. En la actualidad, el mapeo de proteínas humanas se realiza utilizando electroforesis en gel 2D.

Aplicaciones de proteómica

Existen muchas ventajas de estudiar proteómica, ya que las proteínas son las moléculas de gobierno de la mayor parte de la actividad debido a la propiedad de las proteínas del catalizador. Por lo tanto, el estudio de proteínas enteras puede proporcionar información sobre el estado de salud de un organismo. Algunas aplicaciones son;

1. Anotación del genoma: Al estudiar el contenido de proteínas de un organismo, se pueden determinar los genomas exactos responsables del compuesto de proteína activa. En este escenario, los resultados de todos los genómicos, la transcriptómica y la proteómica son importantes.
2. Identificación / diagnóstico de la enfermedad: La proteómica se usa en la identificación de la afección de la enfermedad, comparando lo sano y el enfermo
3. Llevar a cabo expresión de proteínas estudiado durante la experimentación.
4. Modificaciones de proteínas y estudios de interacción: Para usar proteínas en vitro condiciones o y en vivo condiciones, decidir las condiciones de almacenamiento de estas proteínas extraídas y estudiar el comportamiento de la proteína en in vitro, en vivo y en - Métodos de silico.

Figura 01: Proteómica

Existen diferentes técnicas involucradas en proteómica

1. Extracción de la proteína total y separando las proteínas usando electroforesis en gel 2D. Las proteínas también se pueden separar utilizando la cromatografía líquida de alto rendimiento (HPLC).
2. Secuenciación de las proteínas extraídas utilizando métodos como el método de secuenciación de Edmund o la espectrometría de masas.
3. Una vez que se identifican las secuencias, las propiedades estructurales y funcionales del contenido de proteínas se analizan utilizando software basado en computadora y herramientas bioinformáticas.

¿Qué es la transcriptómica??

El término del transcriptoma se acuña recientemente. La transcriptómica es el estudio del contenido total de ARNm de un organismo. El ARNm total es el ADN expresado en un organismo vivo o una célula. La colección completa de ARNm se conoce como transcriptoma.

Los pasos para analizar el transcriptoma incluyen,

1. Extracción de ARN, separación de ARNm usando cromatografía en gel de columna con cuentas de poli DT.
2. La secuenciación del ARNm se realiza.

La tecnología de microarrays es una forma común de identificar el transcriptoma de un organismo. La técnica de microarray implica una placa de sonda con los hilos complementarios del transcriptoma. Tras la hibridación, el ARNm presente en el organismo o las células se puede caracterizar.

Figura 02: Técnicas transcriptómicas

La transcriptómica ahora se usa ampliamente en el campo de la medicina. Diagnóstico de enfermedades y perfiles de enfermedades son campos principales en los que se usa la transcriptómica. Al analizar un transcriptoma de un organismo, se puede identificar el ARNm extranjero, y si hay infecciones, se puede identificar. El ARN no codificante se puede separar utilizando tecnologías transcriptómicas. Y también se puede monitorear la expresión de genes bajo diferentes tensiones ambientales.

 ¿Cuáles son las similitudes entre proteómica y transcriptómica??

• Ambos forman parte del concepto de tecnología ómica.
• Ambos se usan en diagnósticos de enfermedades y caracterización de la enfermedad de un organismo.
• Ambas áreas de estudio implicaron la extracción de la biomolécula, la separación de la biomolécula y los pasos de secuenciación.

¿Cuál es la diferencia entre proteómica y transcriptómica??

Resumen -Proteómica VS Transcriptomics 

Los ómicos juegan un papel importante en el campo de las ciencias de la vida. La proteómica se refiere al estudio del proteoma que forma las colecciones completas de proteínas en una célula o un organismo. La transcriptómica se refiere al estudio del transcriptoma, que es el conjunto completo de ADN expresado que está en forma de ARNm. Las dos áreas de estudio, proteómica y transcriptómica, se derivaron después de la introducción de la genómica y actualmente se usaron ampliamente en diagnósticos médicos y en caracterización y detección de organismos. Esta es la diferencia entre proteómica y transcriptómica.

Descargue el PDF de Proteomics vs Transcriptomics

Puede descargar la versión PDF de este artículo y usarla para fines fuera de línea según la nota de cita. Descargue la versión PDF aquí: Diferencia entre proteómica y transcriptómica

Referencia:

1.Horgan, Richard P y Louise C Kenny. "Tecnologías 'omic': genómica, transcriptómica, proteómica y metabolómica."El obstetra y ginecólogo, Blackwell Publishing Inc, 18 de julio de 2011. Disponible aquí  
2.Graves, Paul R., y Timothy A. J. Heno. "Guía de biólogos moleculares para la proteómica."Microbiology and Molecular Biology Reviews, American Society for Microbiology, MAR. 2002. Disponible aquí
3.Lowe, Rohan, et al. "Tecnologías transcriptómicas."PLOS Computational Biology, Biblioteca Pública de Ciencias, mayo de 2017. Disponible aquí  

Imagen de cortesía:

1.'Proteomics'by XXL7441 en English Wikibooks - Transferido de EN.wikibooks a los comunes., (Dominio público) a través de Commons Wikimedia
2.'Microarrays y secuenciación de flujo de celda'by Thomas Shafee - Trabajo propio, (CC por 4.0) a través de Commons Wikimedia