Diferencia entre QTL y GWAS
El diferencia clave entre QTL y GWAS se basa en el tipo de secuencias utilizadas en el análisis. QTL utiliza loci de genes de enlace para analizar los rasgos fenotípicos asociados con la herencia poligénica, mientras que GWAS utiliza secuencias de genoma enteras para analizar polimorfismos de un solo nucleótido de una condición particular.
Los mapas QTL y los GWA juegan un papel importante en los análisis genéticos para diferentes rasgos. Además, son importantes en el análisis de diversas enfermedades con etiología desconocida. Además, la secuenciación juega un papel clave en ambas técnicas. Estas técnicas se pueden combinar con otras técnicas de alto rendimiento para una mayor precisión y precisión.
CONTENIDO
1. Descripción general y diferencia de claves
2. Que es qtl
3. Que es gwas
4. Similitudes entre QTL y GWAS
5. Comparación lado a lado - QTL vs GWAS en forma tabular
6. Resumen
Que es qtl?
QTL significa Locus de rasgo cuantitativo. Es una región del ADN asociada con un rasgo fenotípico. En general, un QTL da lugar a efectos poligénicos. La distribución de QTL varía, y el número de QTL sugiere el grado de variación de un rasgo fenotípico particular. Además, típicamente codifican rasgos continuos subyacentes y no rasgos discretos.
Tras la identificación de las regiones QTL, es importante secuenciar un área QTL particular. Además, para facilitar las investigaciones e investigaciones, la secuencia y el almacenamiento de los datos de secuencia de las regiones QTL comunes tienen lugar con la participación de la bioinformática. Llamamos a esta técnica mapeo QTL. Posteriormente, una base de datos se acumula con las secuencias de la región QTL.
Figura 01: escaneo QTL
Además, las aplicaciones de las secuencias QTL se basan principalmente en la herramienta de explosión, donde se puede determinar la similitud de secuencia. Es importante para deducir relaciones entre organismos. Además, es importante para determinar la complejidad de un fenotipo poligénico particular. También determina la evolución de un rasgo particular.
En la actualidad, el análisis QTL se combina con otras técnicas de alto rendimiento como los microarrays de ADN. Esto es importante en el análisis de expresión del fenotipo. Actualmente, los científicos están muy interesados en desarrollar la base de datos QTL, ya que las regiones QTL son responsables de muchos rasgos importantes de diferentes especies.
Que es gwas?
Gwas significa Estudio de asociación amplia del genoma. También se refiere a estudios de asociación de genoma completo. Estos estudios se centran principalmente en estudios de observación. Analiza las variantes genéticas de diferentes individuos generalmente asociadas con un rasgo específico. Además, todo el genoma es importante para el análisis de GWAS.
Figura 02: GWAS
GWAS es una herramienta importante en el análisis de los polimorfismos de un solo nucleótido asociados con diversas enfermedades. Este es también un estudio comparativo de los diferentes polimorfismos de un solo nucleótido en una amplia población. Además, la muestra de estudio de GWAS es muy alta; Por lo tanto, también toma el formato de un estudio de cohorte transversal.
Además, el primer estudio de GWAS tuvo lugar con respecto al infarto de miocardio y el análisis de los genes asociados con el infarto de miocardio. En la actualidad, GWAS juega un papel importante en la determinación de los antecedentes genéticos de enfermedades complejas con etiología desconocida.
¿Cuáles son las similitudes entre QTL y GWAS??
- Confían en los datos de secuencias de ADN para el análisis.
- Ambos están asociados con los antecedentes genéticos de varios caracteres.
- Además, requieren herramientas bioinformáticas para deducir e interpretar resultados.
- Se realizan en grandes poblaciones.
¿Cuál es la diferencia entre QTL y GWAS??
QTL analiza los rasgos fenotípicos asociados con la herencia poligénica utilizando loci de genes vinculados, mientras que GWAS analiza polimorfismos de un solo nucleótido de una condición particular que usa secuencias de genoma enteras. Por lo tanto, esta es la diferencia clave entre QTL y GWAS. El mapeo QTL es relativamente una técnica menos compleja que GWAS, ya que requiere una secuenciación de genoma completo.
La siguiente infografía resume la diferencia entre QTL y GWAS en forma tabular.
Resumen -QTL vs GWAS
El mapeo QTL y los GWA juegan un papel importante en la determinación del fondo genético de varios rasgos fenotípicos. También ayudan a analizar los antecedentes genéticos de diferentes enfermedades. El mapeo QTL mapea los genes de enlace responsables de los rasgos continuos, y también implica mapeo de los genes de herencia poligénica. GWAS, por otro lado, tiene lugar con el análisis de genoma completo para polimorfismos de un solo nucleótido. Además, esto tiene lugar en una población más grande. Por lo tanto, este es el resumen de la diferencia entre QTL y GWAS.
Referencia:
1. Liu, Ruixian, et al. “Análisis GWAS e identificación QTL de rasgos de calidad de fibra y componentes de rendimiento en algodón de tierras altas utilizando marcadores SNP de alta densidad enriquecidos."Frontiers in Plant Science, Frontiers Media s.A., 13 de septiembre. 2018, disponible aquí.
2. "Gwas vs. Mapeo QTL?"Últimas publicaciones, disponibles aquí.
Imagen de cortesía:
1. "Ejemplo de un QTL-Scan de todo el genoma de PLoS Biology" por-STYRKARSDOTTIR U, Cazier JB, Kong A, Rolfsson O, Larsen H, et al. (2003) Vinculación de la osteoporosis al cromosoma 20p12 y la asociación con BMP2. PLoS Biol 1 (3): E69 (CC por 2.5) Vía Commons Wikimedia
2. "Efectos de alelo de la enfermedad de Gwas" de Bush WS y Moore JH - Bush WS, Moore JH (2012) Capítulo 11: Estudios de la Asociación de Genoma. PLoS Comput Biol 8 (12): E1002822. doi: 10.1371/diario.PCBI.1002822, (CC por 2.5) Vía Commons Wikimedia
