Diferencia entre RAPD y RFLP

Diferencia clave: RAPD vs RFLP
 

Los marcadores genéticos se usan en biología molecular para identificar variaciones genéticas entre individuos y especies. ADN polimórfico amplificado aleatorio (Rapd) y Polimorfismo de longitud de fragmento de restricción (RFLP) son dos marcadores moleculares importantes utilizados rutinariamente en laboratorios. RAPD se realiza con cebadores oligonucleótidos cortos y arbitrarios, y se basa en la amplificación aleatoria de las múltiples ubicaciones a lo largo de la plantilla ADN del organismo.  RFLP se realiza con una endonucleasa de restricción específica, y se basa en el polimorfismo de los fragmentos de restricción y la hibridación resultantes. La diferencia clave entre RAPL y RFLP es que RAPD es un tipo de técnica de PCR realizada sin el conocimiento de la secuencia anterior mientras RFLP no está involucrado en PCR y requiere un conocimiento de secuencia previo para llevar a cabo la técnica.

CONTENIDO
1. Descripción general y diferencia de claves
2. Que es RAPD
3. Que es rflp
4. Comparación de lado a lado - RAPD VS RFLP
5. Resumen

Que es RAPD?

RAPD es un marcador molecular útil en biología molecular. Es una técnica rápida y fácil. RAPD se puede definir como un método que da como resultado secuencias de ADN polimórficos como resultado de la amplificación aleatoria de múltiples ubicaciones de la plantilla de ADN objetivo. RAPD utiliza cebadores de oligonucleótidos cortos con secuencias arbitrarias para la amplificación de PCR. Los cebadores se sintetizan artificialmente sin el conocimiento de la secuencia anterior. Por lo tanto, se considera una técnica fácil y útil.

Los siguientes pasos principales están involucrados en RAPD.

1. Extracción del ADN objetivo
2. Amplificación de las múltiples ubicaciones del ADN objetivo utilizando cebadores elegidos al azar
3. Electroforesis en gel de los productos de PCR amplificados
4. Tinción con bromuro de etidio e identificación del polimorfismo

Como resultado de la variación en el recocido del cebador, se generan diferentes fragmentos con diferentes longitudes durante la amplificación. Por lo tanto, los patrones de bandas en los geles son diferentes entre individuos y especies. Por lo tanto, RAPD permite la detección de la variación genética entre los organismos en la identificación y diferenciación.

RAPD se aplica en varios estudios de biología molecular, como la identificación de la diferencia genética entre especies estrechamente relacionadas, mapeo génico, huellas dactilares de ADN, identificación de enfermedades hereditarias, etc.

Figura 01: Rapd

Que es rflp?

Restricción Longitud de fragmento Los polimorfismos (RFLP) es un marcador molecular utilizado en la biología molecular para la identificación de la variación genética en secuencias de ADN homólogos. Es el primer marcador genético desarrollado para las huellas dactilares de ADN. Todos los organismos producen perfiles de ADN únicos cuando se limitan con enzimas de restricción específicas. RFLP sirve como una herramienta importante para producir perfiles de ADN únicos de individuos y la detección de la variación genética entre ellos. Cuando las muestras de ADN se digeren con endonucleasas de restricción específicas, produce diferentes perfiles de ADN que son exclusivos de cada individuo. Por lo tanto, el principal de este método es la detección de la variación genética entre los organismos al restringir el ADN homólogo con enzimas de restricción específicas y el análisis del polimorfismo de longitud de fragmento a través de la electroforesis en gel y transferencia. Los patrones de transferencia son exclusivos de cada organismo y caracterizan los genotipos específicos.

Los siguientes pasos están involucrados con RFLP.

1. Aislamiento de una cantidad suficiente de ADN de muestras
2. Fragmentación de las muestras de ADN con endonucleasas de restricción específicas en secuencia corta
3. Separación de los fragmentos resultados con diferentes longitudes por electroforesis en gel de agarosa.
4. Transferencia del perfil de gel a una membrana por Southern Blotting
5. Hibridación de la membrana con sondas marcadas y análisis del polimorfismo de longitud de fragmento en cada perfil

RFLP tiene varias aplicaciones, como el diagnóstico de enfermedades de herencia, mapeo del genoma, identificación penal en estudios forenses, pruebas de paternidad, etc.

Figura 02: Genotipado RFLP

¿Cuál es la diferencia entre RAPD y RFLP??

Resumen -RAPD vs RFLP

RAPD y RFLP son marcadores importantes utilizados en la biología molecular. Ambos métodos son capaces de detectar la variación genética entre los organismos. RAPD se realiza con cebadores aleatorios. RFLP se realiza utilizando enzimas de restricción específicas. Ambos métodos producen perfiles de ADN exclusivos de organismos individuales. RAPD está involucrado comparablemente unos pasos que RFLP. Pero produce resultados menos confiables y reproducibles que RFLP. Esta es la principal diferencia entre RAPD y RFLP.

Referencias:
1. Dos, J. B., J. Nienhuis, P. Skroch, J. Tivang y M. K. Chapoteo. "Comparación de marcadores genéticos RAPD y RFLP para determinar la similitud genética entre Brassica oleracea L. genotipos." ETIQUETA. Genética teórica y aplicada. Theoretische und Angewandte Genetik. U.S. Biblioteca Nacional de Medicina, Mar. 1994. Web. 12 de abril. 2017
2. Powell, Wayne, Michele Morgante, Chaz Andre, Michael Hanafey, Julie Vogel, Scott Tingey y Antoni Rafalski. "La comparación de RFLP, RAPD, AFLP

Imagen de cortesía:
1. "Genotipado RFLP" por (desconocido) - Institutos Nacionales de Salud (dominio público) a través de Commons Wikimedia