Diferencia entre shrna y siRNA

shrna vs siRNA

Durante el proceso de interferencia de ARN (RNAi), la expresión de un gen objetivo se derriba con alta especificidad y selectividad. El ARNi es un proceso natural, e implica un pequeño ARN interferente (siRNA) y ARN de horquilla corto (shRNA) y shRNA bi-funcional. Actualmente, el ARNi se usa ampliamente como herramienta para la terapia personalizada del cáncer. Las aplicaciones de RNAi se realizan básicamente con el siRNA de doble cadena de cadena químicamente sintetizada y las moléculas de shRNA basadas en vectores. Aunque estas dos moléculas tienen resultados funcionales similares, difieren en su estructura; Por lo tanto, los mecanismos moleculares de acción, las vías de ARN y los efectos fuera del objetivo de estas dos moléculas también difieren.

shrna

shRNA es una secuencia de una pequeña molécula de ARN que realiza un giro de horquilla apretada que se puede usar para silenciar una expresión del gen objetivo durante el ARNi. La expresión de shRNA se logra mediante un vector, que puede ser un virus o una bacteria o mediante el suministro de plásmidos. Se sintetizan en el núcleo de las células y se transportan al citoplasma para obtener más procesos. Estas moléculas tienen vías de maduración similares de miRNA; Por lo tanto, la síntesis de miRNA ha proporcionado las bases para la comprensión de la síntesis de sharm. Ya sea la ARN polimerasa II o III puede transcribir shRNA a través de los promotores de ARN polimerasa II o III. La ventaja del uso de shRNAS es que tienen una tasa de degradación y rotación relativamente baja. La desventaja es que necesita un vector de expresión, lo que puede causar algunos problemas de seguridad.

siro

Los siRNA son moléculas de ARN de doble cadena compuesta por 20- 25 pares de bases de longitud. Estos se utilizan para la supresión de genes al silenciar cualquier gen con secuencia de nucleótidos complementarios en la vía de ARNi. La eliminación del gen por transfección de siRNA a menudo no tiene éxito debido al efecto transitorio; especialmente en las células que se dividen rápidamente y la supresión no dura más. Para superar este problema, el siRNA se modifica introduciendo una estructura de horquilla corta. Esta molécula modificada entonces conocida como shrna. shRNA debe ser convertido a siRNA por un Dicer para continuar su función normal.

¿Cuál es la diferencia entre shrna y sirna??

• A diferencia del siRNA, el shRNA tiene una estructura de horquilla adicional. shrna es una versión modificada de sirna.

• SHRNA requiere un vector de expresión, mientras que siRNA no.

• El shRNA se puede usar para la eliminación a largo plazo, mientras que el siRNA solo se puede usar para la eliminación de genes a corto plazo.

• A diferencia de la supresión génica del siRNA, la supresión del sharhn es duradera y si se inserta a través de un vector viral apropiado, puede producir efectos permanentes de silenciamiento génico.

• Se requiere que Dicer vuelva a convertir el shRNA a la molécula de siRNA para ejecutar sus funciones normales.