Diferencia entre Synteny y Collineality

Diferencia entre Synteny y Collineality

El diferencia clave Entre Synteny y Collineality es que Synteny es la co-localización física de los loci genéticos en el mismo cromosoma en las especies, mientras que la colinealidad es la co-localización física de los loci genéticos en el mismo cromosoma en diferentes especies que conservan el mismo orden.

Synteny y Collineality son dos términos que se utilizan indistintamente en genómica. Ambos términos describen los patrones de localización de genes en los cromosomas en diferentes especies. Estos acuerdos genéticos relacionados entre los taxones son información valiosa al inferir ascendencia compartida de genes. Synteny se refiere a la co-localización física de los loci genéticos en el mismo cromosoma en especies. La colinealidad se refiere a la co-localización física de los loci genéticos en el mismo cromosoma en diferentes especies que conservan el mismo orden. Por lo tanto, es una forma de synteny.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia de claves
2. Que es Synteny 
3. ¿Qué es la colinealidad?
4. Similitudes entre Synteny y Collineality
5. Comparación de lado a lado - Synteny vs Collineality en forma tabular
6. Resumen

Que es Synteny?

En diferentes especies, hay un conjunto de genes ubicados en el mismo cromosoma. Y, esta conjocionalización física de genes en el mismo cromosoma en diferentes especies se conoce como Synteny. Además, estos genes se encuentran muy cerca uno del otro en un solo cromosoma. El orden de los genes puede no ser necesariamente el mismo. Pero, la localización de genes cerca uno del otro en el mismo cromosoma tiene lugar en Synteny. Por lo tanto, Synteny describe principalmente el patrón de distribución de genes en un cromosoma. Estos patrones de co-localización de genes indican relaciones entre diferentes especies y su evolución. Sin embargo, la synteny se puede interrumpir debido a reordenamientos cromosómicos como translocaciones, inversión y fusión cromosómica, etc. Duplicaciones, pérdida y recombinación homóloga desigual.

Figura 01: Synteny

Se cree que todos los genes vinculados son sinténicos. Sin embargo, no todos los genes sinténicos están necesariamente vinculados. Poseen secuencias cromosómicas comunes. Los humanos tienen muchos genes sinténicos con otros mamíferos. Además, muchos cereales tienen genes sinténicos.

¿Qué es la colinealidad??

La colinealidad es una forma más específica de sintenia en la que un conjunto de genes se encuentran en el mismo cromosoma de diferentes especies en el mismo orden que en las especies ancestrales. Por lo tanto, si hay una desviación de la colinealidad, será un carácter filogenético más confiable ya que la colinealidad explica la ascendencia compartida de los genes.

Figura 02: Collineality

El análisis de colinealidad múltiple proporciona información mucho más confiable sobre las especies relacionadas y su filogenia.

¿Cuáles son las similitudes entre Synteny y Collineality??

  • Tanto en Synteny como en colinealidad, un conjunto de loci en dos especies diferentes se encuentra en el mismo cromosoma.
  • Estos términos describen la co-localización física de los loci genéticos en el mismo cromosoma.
  • La colinealidad es una forma más específica de synteny.
  • A veces, ambos términos se usan indistintamente en genómica.
  • Si dos regiones tienen colinealidad, obviamente son singentes.
  • Son útiles para inferir filogenia.

¿Cuál es la diferencia entre Synteny y Collineality??

Synteny y Collineality son dos términos que se utilizan indistintamente en genómica. Synteny se refiere a la co-localización física de un conjunto de genes en el mismo cromosoma en diferentes especies. La colinealidad es una forma de sintenia en la que el conjunto de genes se localizan en el mismo orden entre las diferentes especies. Por lo tanto, esta es la diferencia clave entre Synteny y Collineality.

Resumen -Synteny vs Collineality

Los términos sintteny y colinealidad se refieren a un conjunto de genes que se encuentran en el mismo cromosoma en diferentes especies. De hecho, estos genes se localizan en el mismo cromosoma en diferentes especies. Synteny describe la co-localización física de los genes establecidos en el mismo cromosoma en diferentes especies, mientras que la colinealidad es una forma de sintenia más específica en la que el conjunto de genes se localizan en el mismo orden. Por lo tanto, esto resume la diferencia entre Synteny y Collineality.

Referencia:

1. "Synteny". Interno.Wikipedia.Org, 2020, disponible aquí.
2. "Genómica y genómica comparativa". Integratedbreeding.Net, 2020, disponible aquí.

Imagen de cortesía:

1. "Synteny de ratón humano" de Sinha Au, Meller J. - Bioinformática BMC. 2007 8 de marzo; 8: 82 [PMID: 17343765] (CC por 2.0) a través de sscommons wikimedia