Diferencia entre la secuenciación del genoma completo y la secuenciación del exoma

El diferencia clave Entre la secuenciación del genoma completo y la secuenciación del exoma es que el Secuenciación del genoma completo todo el genoma de un organismo, mientras que la secuencia del exoma secuencia solo el exoma o los genes codificadores de proteínas de un organismo.

La secuenciación es una técnica que determina el orden preciso de los nucleótidos en una molécula de ADN particular. Simplemente refleja el orden correcto de las cuatro bases; adenina (a), guanina (g), citosina (c) y timina (t) en un fragmento de ADN. Existen varios métodos de secuenciación, como secuenciación de Sanger, secuenciación de próxima generación, etc. Además, el genoma completo de un organismo (secuenciación de genoma completo) o solo los genes que codifican proteínas en el genoma (secuenciación del exoma) pueden sufrir secuenciación.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia de claves
2. ¿Qué es la secuenciación del genoma completo?
3. ¿Qué es la secuenciación del exoma?
4. Similitudes entre la secuenciación del genoma completo y la secuenciación del exoma
5. Comparación lado a lado: secuenciación de genoma completo frente a secuenciación exoma en forma tabular
6. Resumen

¿Qué es la secuenciación del genoma completo??

El genoma humano contiene casi tres mil millones de pares de bases de ADN. Toda la secuenciación del genoma es un método que secuencia el genoma completo de un organismo. Por lo tanto, en la secuenciación del genoma completo, la consideración está en toda la colección de moléculas de ADN, incluidos exomas, intrones, espacios intergénicos, etc. Además, todas las secuencias de secuenciación del genoma no solo el genoma que reside dentro del núcleo sino también el ADN mitocondrial.

Figura 01: secuenciación del genoma completo

Al prepararse para esta secuenciación, el primer paso es extraer todo el ADN. Luego, el ADN extraído sufre el procedimiento de secuenciación utilizando un método de secuenciación adecuado. Al analizar las secuencias resultantes, utilizando una herramienta bioinformática, podemos descubrir las enfermedades raras, el cáncer, las enfermedades infecciosas, etc.

¿Qué es la secuenciación del exoma??

El exoma es parte del genoma que contiene aproximadamente 1.5% del genoma, y ​​es la colección de exones. Los exones son las secuencias que se transcriben en ARNm y luego al producto de proteína final. Por lo tanto, secuenciación del exoma secuencia todas las secuencias de codificación de proteínas en el genoma. La secuenciación del exoma revela los trastornos genéticos ya que surgen la mayoría de los trastornos genéticos debido a las mutaciones de los genes que codifican proteínas. Por lo tanto, los procesos de diagnóstico de los trastornos genéticos con frecuencia usan la secuenciación del exoma como método para diagnosticar la enfermedad. Además, al compararse con toda la aplicación de secuenciación del genoma para pruebas genéticas, la secuenciación del exoma lleva menos tiempo emplearse y es menos costosa.

Figura 02: secuenciación del exoma

En la secuenciación del exoma, primero, es necesario seleccionar solo las secuencias de codificación de proteínas del ADN total. Tenga en cuenta que los humanos tienen alrededor de 180000 secuencias de codificación de proteínas. Luego, el exoma se secuencia utilizando un método de secuenciación de alto rendimiento.

¿Cuáles son las similitudes entre la secuenciación del genoma completo y la secuenciación del exoma??

• La secuenciación completa del genoma y la secuenciación del exoma son dos aplicaciones de secuenciación.
• Ambos métodos son útiles para determinar el orden correcto de la secuencia de nucleótidos en ambos métodos.
• Además, la bioinformática ayuda en ambas técnicas para analizar los datos.

¿Cuál es la diferencia entre la secuenciación del genoma completo y la secuenciación del exoma??

Secuenciación del genoma completo todo el ADN del genoma de un organismo, mientras que la secuencia del exoma secuencia solo las secuencias de codificación de proteínas del genoma. Por lo tanto, esta es la diferencia fundamental entre la secuenciación del genoma completo y la secuenciación del exoma. Además, aunque ambos métodos están ampliamente en uso para determinar el orden correcto de la secuencia de nucleótidos, toda la secuenciación del genoma es costosa y requiere mucho tiempo que la secuenciación del exoma.

La siguiente infografía tabula la diferencia entre la secuenciación del genoma completo y la secuenciación del exoma.

Resumen: secuenciación de genoma completo frente a la secuenciación de exoma

La secuenciación revela el orden preciso de las bases en un fragmento de ADN y puede ser una secuenciación de genoma completo o secuenciación del exoma. Aquí, todo el genoma secuencia de la secuencia del genoma el genoma completo de un organismo, mientras que la secuencia del exoma secuencia solo las secuencias de codificación de proteínas en el genoma. Teniendo en cuenta sus aplicaciones, toda la secuenciación del genoma es útil para analizar las aberraciones genéticas, como las variaciones de un solo nucleótido, deleciones, inserciones, etc. en todo el genoma, mientras que la secuenciación del exoma es útil para detectar las enfermedades genéticas. Por lo tanto, esta es la diferencia entre la secuenciación del genoma completo y la secuenciación del exoma.

Referencia:

1."Genome completo vs. Secuenciación de exoma entero vs. Paneles de secuenciación dirigidos."Healio, Slack Incorporated. Disponible aquí  
2."¿Qué son la secuenciación de exoma completo y la secuenciación del genoma completo?? - Referencia de genética en el hogar - NIH."U.S. Biblioteca Nacional de Medicina, Institutos Nacionales de Salud. Disponible aquí  

Imagen de cortesía:

1."Secuenciación de escopeta de genoma entero versus secuenciación de escopeta jerárquica" por Comins, J., Toft, c., Tarifas, m. A. - “Métodos de biología computacional y su aplicación a la genómica comparativa de las bacterias simbióticas endocelulares de los insectos."(CC BY-SA 2.5) Vía Commons Wikimedia  
2."Flujo de trabajo de secuenciación del exoma 1a" de Sarahkusala - trabajo propio, (CC por 3.0) a través de Commons Wikimedia