¿Cuál es la diferencia entre CRRNA tracRRNA y GRNA?

El diferencia clave Entre el ARNr tracRRNA y el ARNm es que el ARNm es uno de los dos tipos de ARN de CRISPR, que es complementario a la secuencia de ADN objetivo, mientras que el tracRRNA es el segundo tipo de ARN de CRISPR, que sirve como un andamio de unión para la nucleasa y la nucleasa de CAS y GRNA es uno de los dos componentes principales del sistema CRISPR-CAS9 de bacterias y arqueas que reconoce el ADN objetivo y guía las proteínas CAS para hacer roturas de doble cadena en el ADN objetivo.

CRISPR significa repeticiones palindrómicas cortas intercaladas regulares regulares agrupadas. Es uno de los sistemas inmunes en bacterias y arqueas. Las bacterias y las arqueas usan este sistema para protegerse de los patógenos virales. Es uno de los mecanismos más sorprendentes que implica una modificación genética exitosa. Este mecanismo (CRISPR-CAS9) se utiliza como una nueva herramienta de edición de genes en biotecnología. Ha traído nuevos avances a la biotecnología, especialmente en el campo de la ingeniería genética.

Hay dos componentes principales del sistema CRISPR-CAS9. Son ARN guía (GRNA) y nucleasas asociadas a CRISPR (CAS). El ARN guía es una secuencia de ARN específica que guía las proteínas CAS para escindir el ADN objetivo. Guide RNA consta de dos tipos de ARN. Son ARN CRISPR (ARNm) y tracRRNA. Las nucleasasas de CRISPR (CAS) son endonucleasas no específicas que hacen roturas de doble cadena en el ADN objetivo. Al hacer roturas de doble cadena en el ADN objetivo, las bacterias y las arqueas dirigen sus mecanismos de reparación endógenos para inactivar el ADN viral.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia de claves
2. ¿Qué es CRRNA?  
3. ¿Qué es tracrrn? 
4. Que es grna
5. Similitudes - CRRNA tracRRNA y GRNA
6. CRRNA vs tracRRNA vs GRNA en forma tabular
7. Resumen - CRRNA vs TracRRNA vs GRNA

¿Qué es CRRNA??

CRRNA o ARN CRISPR es uno de los dos tipos de ARN guía. Estructuralmente, es una secuencia de nucleótidos de 17-20. La característica más valiosa de CRRNA es que es complementaria al ADN objetivo. Por lo tanto, el ARNr coincide con la secuencia de ADN viral. La especificidad del sistema CRISPR-CAS 9 depende de CRRNA. En las bacterias, CRRNA existe fusionado con la secuencia de tracRRNA, que es el segundo tipo de ARN CRISPR. La producción de ARNr se desencadena por la reexposición de bacterias a un virus. Cuando se expone, tiene lugar la transcripción del gen que está codificando CRRNA. Entonces, el mecanismo de defensa comienza contra el virus.

Figura 01: sistema CRISPR-CAS9

¿Qué es tracrrn??

ARNr o tracRRNA trans-activador es la segunda parte de Guiderna o ARN CRISPR. Se pronuncia como ARN trazador.  El tracRRNA sirve como andamio de unión para la proteína de endonucleasa CAS 9. En otras palabras, el tracRRNA funciona como el mango para guiar a Cas9 hacia el ADN objetivo. Estructuralmente, el tracRRNA tiene 42 nucleótidos. Existe combinado con CRRNA.

Que es grna?

Guide RNA o GRNA es uno de los dos componentes principales del sistema inmunitario CRISPR-CAS9. Es una secuencia de ARN específica compuesta de dos elementos: CRRNA y tracRRNA. GRNA reconoce el ADN objetivo y dirige las proteínas CAS para hacer roturas de doble cadena en el ADN objetivo. Para hacerlo, CRRNA consiste en una secuencia complementaria de ADN objetivo, mientras que el tracRRNA guía las proteínas CAS que funcionan como mango.

Figura 02: GRNA

Diseñar el GRNA correcto es un paso crítico en la herramienta de edición de genes CRISPR-CAS9. Por lo tanto, el éxito y la eficiencia de edición del sistema CRISPR dependen de la secuencia correcta de GRNA. El GRNA se puede expresar en células de un plásmido transfectado. Cuando los plásmidos clonados se introducen en las células, las células huésped generan GRNA. El GRNA más comúnmente generado comprende 100 pares de bases.

¿Cuáles son las similitudes entre CRRNA tracRRNA y GRNA??

• CRRNA, tracRRNA y GRNA son secuencias de ARN que se encuentran en bacterias y arquea.
• Todos pertenecen al sistema CRISPR.
• GRNA está hecho de ARNr y tracRRNA.
• Están involucrados en reconocer el ADN de bacteriófago y las endonucleasas guiantes hacia el ADN objetivo.
• Por lo tanto, los tres tipos de ARN están involucrados en la dirección de la nucleasa Cas9 para hacer descansos de doble cadena en la invasión de materiales genéticos extraños.
• El éxito del experimento CRISPR depende de los tres tipos de ARN.

¿Cuál es la diferencia entre CRRNA tracRRNA y GRNA??

El ARNr es una parte del ARNt de CRISPR que es complementario al ADN objetivo, mientras que el tracRRNA es la segunda parte de GRNA, que sirve como un andamio de unión para la nucleasa CAS. GRNA es la combinación de ARNm y tracRRNA, y es uno de los dos componentes del sistema CRISPR-CAS9, que reconoce el ADN objetivo y guía las nucleasas para hacer roturas de doble cadena en el ADN objetivo. Entonces, esta es la diferencia clave entre CRRNA tracRRNA y GRNA.

La siguiente tabla resume la diferencia entre el tracRRNA y GRNA.

Resumen - CRRNA vs TracRRNA vs GRNA

El sistema CRISPR-CAS9 es un sistema inmune de bacterias y arquea. Este sistema se utiliza como una herramienta de edición de genes en biotecnología. CRISPR consiste en dos tipos de ARN, a saber, ARN CRISPR (ARNc) y ARN CRISPR transactivador (tracRRNA). Se conocen colectivamente como Guiderna o Grna. Este ARN reconoce las secuencias objetivo de los patógenos invasores y las endonucleasas de guías para hacer roturas de doble cadena en el ADN objetivo. Una vez que se realizan roturas de doble cadena en el material genético extraño, el mecanismo de reparación endógeno (unión no homóloga; NHEJ) inactiva el ADN extraño al introducir mutaciones. Por lo tanto, esto resume la diferencia entre el tracRRNA y GRNA.

Referencia:

1. "ARN guía."Una descripción general | Temas de ciencias.
2. Karvelis, Tautvydas, et al. “ARNr y tracRRNA guían la interferencia de ADN mediada por Cas9 en Streptococcus thermophilus."RNA Biology, Landes Bioscience, mayo de 2013.

Imagen de cortesía:

1. "Modo de acción CRISPR-CAS9" de Viktoriaanselm-Trabajo propio (CC BY-SA 4.0) a través de Commons Wikimedia
2. "GRNA-CAS9" de Marius Walter-Archivo: GRNA-CAS9.PNG (CC BY-SA 4.0) a través de Commons Wikimedia