¿Cuál es la diferencia entre its1 y its2?

El diferencia clave entre its1 y its2 es que ITS1 es un ADN espaciador ubicado entre 18S y 5.Genes de rRNA 8s en eucariotas, mientras que ITS2 es un ADN espaciador ubicado entre 5.Genes de rRNA 8S y 28S en eucariotas.

El espaciador transcrito interno (ITS) es el ADN espaciador generalmente ubicado entre el ARN ribosómico de la subunidad pequeña y los genes de ARN ribosómico de subunidad grandes en el cromosoma o en la región transcrita correspondiente en la transcripción de la transcripción policistrónica de ARNm. En bacterias y arqueas, solo hay una sola entre los genes de ARNr 16S y 23S. Pero en los eucariotas, hay dos su ADN espaciador: ITS1 (entre 18S y 5.Genes de rRNA 8s) e ITS2 (entre 5.8S y 28S rRNA). Por lo tanto, ITS1 e ITS2 son dos ADN espaciador que se encuentran entre los genes de rRNA en eucariotas.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia de claves
2. Que es its1 
3. Que es its2
4. Similitudes: its1 y its2
5. ITS1 vs ITS2 en forma tabular
6. Resumen

Que es its1?

ITS1 es un ADN espaciador ubicado entre 18S y 5.8s genes de rRNA en eucariotas. Se refiere a una pieza de ADN espaciador no funcional ubicado entre los genes de rRNA. ITS1 tiene una variación de mayor longitud que ITS2. La variación de longitud de ITS1 es aproximadamente (200-300 pb). Sus marcadores como ITS1 han demostrado su eficiencia en la aclaración de las relaciones filogenéticas entre diferentes taxones. Además, el ADN del espaciador its1 está menos conservado que el ADN del espaciador ITS2. Las estructuras de sus1 solo se conservan en unidades taxonómicas mucho más pequeñas. Cada grupo ribosómico eucariota también contiene regiones llamadas espaciadores transcritos externos (ETS 5 'y 3').

Figura 01: ITS1 Región

El ADN del separador ITS1 está muy cerca del espaciador transcrito 5'external (5 'ETS). Además, si alguien quiere amplificar la región ITS1 para los estudios de relaciones filogenéticas, tiene que usar un par de cebadores específico (cebadores reversos y avanzados) para este propósito. Para amplificar la región ITS1, dos conjuntos de cebadores se usan normalmente en los protocolos de PCR de los laboratorios. Son su1 delantero y su 2 reverso o its1 foward y su 4 reverso.

Que es its2?

ITS2 es un ADN espaciador ubicado entre 5.Genes de rRNA 8S y 28S en eucariotas. La región its2 tiene una variación de longitud más corta que la región ITS1. La variación de longitud de ITS2 es aproximadamente (180-240bp). Sin embargo, la región its2 está más conservada que su región 1 en muchas unidades taxonómicas. Identifica que todas las secuencias de su2 comparten un núcleo común de la estructura secundaria. Además, el 40% de la región ITS2 se conserva entre todas las angiospermas, mientras que es posible alinear el 50% de la región ITS2 a través de la familia y el nivel superior.

Figura 02: Región ITS2

Independientemente del alcance de la conservación, el uso de la región ITS2 también muy popular, como la región ITS1 en los estudios de relaciones filogenéticas, especialmente en el código de barras de ADN fúngico. Para amplificar la región ITS2, generalmente se usa un conjunto de cebadores específico en los protocolos de PCR de los laboratorios. Ese es su1 Foward y su 4 reverso. Pero cuando el protocolo de PCR usa este conjunto de cebadores, también amplifica su región 1 junto con la región ITS2. Además, el ADN del espaciador ITS2 está muy cerca del espaciador transcrito en 3'External (3 'ETS).

Similitudes entre its1 y its2

• ITS1 e ITS2 son dos ADN espaciador ubicado entre los genes rRNA.
• Están presentes solo en eucariotas.
• Ambos pueden amplificarse utilizando pares de cebadores específicos.
• Ambos se extraen en la maduración de rRNA como subproductos no funcionales.
• Ambos son muy importantes para los estudios de relaciones filogenéticas, especialmente en el código de barras de ADN fúngico.

Diferencia entre its1 y its2

ITS1 es un ADN espaciador presente entre 18S y 5.8s genes rRNA en eucariotas, mientras que ITS2 es un ADN espaciador ubicado entre 5.Genes de rRNA 8S y 28S en eucariotas. Entonces, esta es la diferencia clave entre ITS1 y ITS2. Además, ITS1 tiene una mayor variación de longitud en comparación con ITS2. Por otro lado, ITS2 tiene una variación de longitud más corta en comparación con ITS1. Esta es otra diferencia entre its1 y its2.

La siguiente infografía enumera las diferencias entre ITS1 y ITS2 en forma tabular para la comparación de lado a lado.

Resumen -ITS1 vs ITS2

La región transcrita interna (ITS) es una pieza de ADN espaciador no funcional ubicada entre los genes de rRNA. En bacterias y arquea, solo hay una sola región. Pero en los eucariotas, hay dos sus regiones: ITS1 y ITS2. ITS1 es un ADN espaciador que se encuentra entre 18S y 5.8s genes rRNA en eucariotas, mientras que ITS2 es un ADN espaciador que se encuentra entre 5.Genes de rRNA 8S y 28S en eucariotas. Por lo tanto, este es el resumen de la diferencia entre ITS1 y ITS2.

Referencia:

1. "Espaciador transcrito interno."Una descripción general | Temas de ciencias.
2. Schoch, Conrad L., et al. “Región de espaciador interno ribosómico nuclear (ITS) como marcador de código de barras de ADN universal para hongos."PNAS, Academia Nacional de Ciencias.

Imagen de cortesía:

1. "Eucaryot rDNA" por - Pharaoh Han asumió - No se proporciona ninguna fuente legible por máquina. Trabajo propio asumido (basado en reclamos de derechos de autor) (CC By-SA 3.0) a través de Commons Wikimedia
2. "Molecularkerssymbiodinium" de Allisonmlewis - Trabajo propio (CC By -SA 4.0) a través de Commons Wikimedia