¿Cuál es la diferencia entre líneas y sines?

El Diferencia clave entre líneas y senos es que las líneas (elementos nucleares intercalados largos) son un tipo de retrotransposones más largos que no son LTR, mientras que los senos (elementos nucleares intercalados cortos) son un tipo de retrotransposones que no son LTR mucho más cortos.

Los retrotransposones que no son LTR no contienen repeticiones de terminales largos (LTR). Sin embargo, contienen genes para la transcriptasa inversa, la proteína de unión a ARN, la nucleasa y el dominio de ribonucleasa H. Los retrotransposones que no son LTR tienen repeticiones cortas. Estas repeticiones tienen un orden invertido de bases uno al lado del otro. Además de eso, los retrotransposones no LTR también tienen repeticiones directas que se encuentran en los transposones LRT.  Los retrotransposones no LTR se dividen en dos categorías como líneas y senos.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia de claves
2. Que son las líneas 
3. Que son sines
4. Similitudes -líneas vs sines
5. Líneas vs sines en forma tabular
6. Resumen

Que son las líneas?

Las líneas (elementos nucleares intercalados largos) son retrotransposones sin LTR más largos. Están muy extendidos en los genomas de los eucariotas. Generalmente componen 21.1% del genoma humano. Cada línea tiene alrededor de 7000 pares de bases de largo. Las líneas pueden transcribirse en ARNm y traducirse en una proteína que puede funcionar como una enzima transcriptasa inversa. Esta transcriptasa inversa produce copias de ADN del ARN de líneas. Estas copias de ADN se pueden integrar en el genoma en un nuevo sitio.

Figura 01: líneas y senos

El genoma humano tiene solo una línea abundante llamada línea-1. El elemento Line-1 tiene alrededor de 6000 pares de bases de largo. Hay alrededor de 100,000 elementos truncados de línea 1 en el genoma humano. La mutación aleatoria puede ocurrir en líneas. Debido a mutaciones aleatorias, las líneas pueden degenerar. Ya no se transcriben ni traducen. Además, las líneas se agrupan en cinco grupos principales como L1, RTE, R2, I y Jockey. Estos cinco grupos subdividen aún más en otros 28 clados.

Las líneas normalmente se propagan a través de un mecanismo llamado mecanismo de transcripción inversa cebada objetivo (TPRT). La inserción de líneas causa enfermedades humanas como la hemofilia A, cáncer, trastornos mendelianos, etc. La hipometilación de líneas también desencadena ciertos tipos de cáncer.

Que son sines?

SINES (elementos nucleares intercalados cortos) son un tipo de retrotransposones que no son LTR mucho más cortos. Tienen unos 100 a 700 pares de bases de longitud. Los senos también son elementos de ADN que se amplifican a través de los genomas eucariotas a través de intermedios de ARN. Sines constituye alrededor del 13% del genoma de los mamíferos.  Las regiones internas de los senos se originan en tRNA. Sigue siendo altamente conservado. A menudo están presentes en muchas especies de vertebrados e invertebrados. La variación del número de copias y las mutaciones en los senos se pueden incorporar para construir la clasificación de especies basada en la filogenia.

Los senes se pueden agrupar en tres tipos principales: clasificaciones centrales, cursos V y amnsines. El elemento Alu es el seno más común en los primates. Además, hay más de 50 enfermedades humanas asociadas con la inserción de los senos. Cuando se insertan dentro o cerca de los exones, pueden causar empalme incorrecto o cambiar el marco de lectura. Esto conduce a fenotipos de la enfermedad como el cáncer de mama, el cáncer de colon, la leucemia, la hemofilia, la fibrosis quística, el cáncer de colon, la enfermedad de las abolladuras, la neurofibromatosis, etc.

¿Cuáles son las similitudes entre líneas y senes??

• Líneas y sinese dos tipos de retrotransposones que no son LTR.
• Ambos no tienen regiones terminales largas (LTR).
• Ambos se encuentran predominantemente solo en eucariotas.
• Ambos no son autónomos.

¿Cuál es la diferencia entre líneas y sines??

Las líneas son retrotransposones no LTR más largos, mientras que los senos son retrotransposones no LTR mucho más cortos. Entonces, esta es la diferencia clave entre las líneas y los sines. Además, las líneas se codifican para la enzima transcriptasa inversa, mientras que SINE no codifica la enzima transcriptasa inversa. Por lo tanto, esta es otra diferencia entre líneas y sines.

Más diferencias entre líneas y senes se enumeran a continuación en forma tabular para la comparación de lado a lado.

Resumen -líneas vs senos

Los retrotransposones se encuentran principalmente en todos los eucariotas pero ausentes en procariotas. Aproximadamente, el 37% del genoma humano contiene retrotransposones. Los retrotransposones son principalmente dos tipos: Retrotransposons LTR y no LTR. Los retrotransposones no LTR no contienen repeticiones terminales largas (LTR), que están presentes en los retrotransposones LTR. Los retrotransposones no LTR se dividen aún más en dos categorías: líneas y senos. Las líneas son retrotransposones no LTR más largos, mientras que los senos son retrotransposones no LTR mucho más cortos. Por lo tanto, este es el resumen de la diferencia entre líneas y sines.

Referencia:

1. "Retrotransposón."Una descripción general | Temas de ciencias.
2. Hancks, Dustin C., y haig h h. Kazio. "Roles para las inserciones retrotransposones en la enfermedad humana."ADN móvil, Biomed Central, 6 de mayo de 2016.

Imagen de cortesía:

1. "Line1 y Sines" de Mariuswalter - Trabajo propio (CC By -Sa 4.0) a través de Commons Wikimedia