¿Cuál es la diferencia entre el perfil del polisoma y el perfil de ribosoma?

¿Cuál es la diferencia entre el perfil del polisoma y el perfil de ribosoma?

El diferencia clave entre el perfil de polisoma y el perfil de ribosoma es que el perfil de polisoma analiza el comportamiento del ribosoma utilizando el ribosoma y el ARNm (polisoma) durante la traducción, mientras que el perfil de ribosoma analiza el comportamiento del ribosoma solo usando la secuencia de ARNm durante la traducción.

La traducción es la segunda fase de la síntesis de proteínas que convierte la información en el ARNm en una secuencia de aminoácidos. Translatomics es un estudio de ORF (marcos de lectura abiertos) que se traducen activamente en una célula de un organismo. Las técnicas de perfil de polisoma y ribosoma son dos tipos de técnicas en el campo de la biología molecular para evaluar e inferir diferentes parámetros en el contexto del análisis del translatoma.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia de claves
2. ¿Qué es el perfil de polysome?
3. ¿Qué es el perfil de ribosoma?
4. Similitudes -Perfil de polisoma y perfil de ribosoma
5. Perfil de polisómetro vs perfil de ribosoma en forma tabular
6. Resumen -Perfil de polisoma vs perfil de ribosoma

¿Qué es el perfil de polysome??

El perfil de polisoma es una técnica que infiere el estado de la traducción de un ARNm específico analizando el comportamiento tanto del ribosoma como del ARNm (polisoma). En otras palabras, esta técnica proporciona datos y conclusiones sobre la asociación de ARNm con ribosomas. El polisoma se refiere al grupo de ribosomas unidos a un ARNm que está presente durante la fase de alargamiento de la traducción.

Figura 01: Perfil de polysome

El perfil de polisoma requiere el lisado celular, que luego se centrifugó. La muestra centrifugada se separa en función de sus densidades para caracterizar las subunidades pequeñas y grandes de los ribosomas y el ARNm correspondiente involucrado en la formación del polisomé. Además, el proceso también implica medir la densidad óptica. Se requiere que los expertos realicen perfiles de polysome.

La técnica de perfil de polisómetro es una herramienta importante para muchas aplicaciones. Los científicos usan esta técnica para estudiar el grado de traducción en las células. Más específicamente, es una herramienta para proporcionar información precisa sobre el estudio de proteínas individuales y sus ARNm específicos. En el contexto de estudiar el grado de traducción de un ARNm en particular, la técnica de perfil de polisoma es vital. Aquí, las secuencias de 3 'y 5' de un ARNm se pueden investigar con referencia a sus efectos sobre la cantidad de ARNm producido y el nivel de traducción.

¿Qué es el perfil de ribosoma??

El perfil de ribosoma es una técnica que analiza el comportamiento del ribosoma con respecto a su ARNm durante la traducción. Esta técnica fue encontrada y desarrollada por Joan Steitz y Marilyn Kozak. Más tarde, esta tecnología fue desarrollada por dos científicos, Nicholas y Jonathan, en combinación con la secuenciación de próxima generación, lo que condujo al desarrollo de diferentes técnicas relacionadas, como la traducción de la metodología de la purificación de afinidad del ribosoma (TRAP).

Figura 02: secuenciación del ribosoma

El procedimiento de perfil de ribosoma implica aislar el ARNm, eliminar el ARN que no está vinculado a los ribosomas y separar el ARNm unido a los ribosomas. Después de este procedimiento, el aislado de ARNm se transcribe inversamente y se produce la síntesis de ADNc. Finalmente, los datos de secuencia se pueden alinear con el perfil de traducción para deducir las características del comportamiento del ribosoma con respecto al ARNm.

El perfil de ribosoma ayuda a muchos investigadores a identificar e inferir la ubicación de los sitios iniciales de traducción, el complemento de marcos de lectura abiertos traducidos (ORF) en una célula o tejido, la distribución de ribosomas en el ARNm y la tasa de ribosomas de traducción. El perfil de ribosoma también se conoce como huella de ribosoma o ribo seq.

¿Cuáles son las similitudes entre el perfil de polisoma y el perfil de ribosoma??

  • El perfil de polisoma y ribosomas son técnicas biológicas moleculares importantes en la investigación.
  • Proporcionan información sobre el proceso de traducción.
  • Ambos procesos de perfiles proporcionan datos a través del análisis del translatomeo.
  • Se necesitan expertos profesionales para realizar ambas técnicas para obtener resultados precisos.
  • Las herramientas bioinformáticas juegan un papel importante en ambas técnicas.

¿Cuál es la diferencia entre el perfil del polisoma y el perfil de ribosoma??

El perfil de polisoma analiza el comportamiento del ribosoma utilizando el ribosoma y el ARNm (polisoma) durante la traducción, mientras que el perfil de ribosoma analiza el comportamiento del ribosoma solo usando la secuencia de ARNm durante la traducción. Por lo tanto, esta es la diferencia clave entre el perfil de polisoma y el perfil de ribosoma. Además, el perfil de polisoma implica técnicas como la centrifugación del gradiente de densidad y las mediciones de densidad óptica, mientras que el perfil de ribosoma implica técnicas de extracción y secuenciación de ARNm. Además, el perfil de ribosoma es más preciso que el perfil de polisoma.

La siguiente infografía presenta las diferencias entre el perfil de polisoma y ribosoma en forma tabular para la comparación de lado a lado.

Resumen -Perfil de polisoma vs perfil de ribosoma

La traducción es la segunda fase de la síntesis de proteínas que implica la conversión de la información sobre la secuencia de ARNm a una secuencia de aminoácidos. Este proceso requiere una plantilla de ARNm, ribosomas, aminoácidos, tRNA y otros factores. El perfil de polisoma y ribosoma son dos técnicas moleculares. El perfil de polisoma analiza el comportamiento del ribosoma utilizando el ribosoma y el ARNm (polisoma) durante la traducción, mientras que el perfil de ribosoma analiza el comportamiento del ribosoma solo usando la secuencia de ARNm durante la traducción. El perfil de polisoma implica técnicas como la centrifugación del gradiente de densidad y las mediciones de densidad óptica. El perfil de ribosoma implica técnicas como extracción de ARNm, síntesis de ADNc y secuenciación. Entonces, esto resume la diferencia entre el perfil de polisoma y el perfil de ribosoma.

Referencia:

1. Chassé, Héloïse, et al. "Análisis de la traducción utilizando perfiles de polisoma."Investigación de ácidos nucleicos, 2016.
2. Jin, Hyun Yong y Changchun Xiao. "Un método integrado de perfiles de polisoma y perfil de ribosoma para investigar el translatoma in vivo."Métodos en Biología Molecular, 2017, PP. 1-18., https: // doi.org/10.1007/978-1-4939-7514-3_1.

Imagen de cortesía:

1. "Técnicas translatómicas importantes" de Polirribosome - Trabajo propio (CC By -SA 4.0) a través de Commons Wikimedia
2. "RibosomeprofileJpg" de Dennispietras - Trabajo propio (CC By -SA 4.0) a través de Commons Wikimedia