¿Cuál es la diferencia entre el xileno cianol y el azul de bromofenol?

¿Cuál es la diferencia entre el xileno cianol y el azul de bromofenol?

El Diferencia clave entre xileno cianol y azul de bromofenol es que en gel de agarosa al 1%, el xileno cianol migra más lento, mientras que el azul de bromofenol migra más rápido.

Xileno cianol y azul de bromofenol son importantes como marcadores de color que se pueden usar para monitorear el proceso de electroforesis en gel de agarosa y electroforesis en gel de poliacrilamida.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia de claves
2. ¿Qué es xileno cianol? 
3. ¿Qué es el azul de bromofenol?
4. Xileno cianol vs azul de bromofenol en forma tabular
5. Resumen - xileno cianol vs bromofenol azul

¿Qué es xileno cianol??

Xylene Cyanol es un marcador de color electroforético o un tinte de seguimiento. Es útil para monitorear el proceso de electroforesis en gel de agarosa y electroforesis en gel de poliacrilamida. Cuando esta sustancia se mezcla con la muestra, la concentración de esta sustancia se vuelve típicamente aproximadamente 0.005% a 0.03%. Algunos sinónimos que podemos usar para el xileno cianol incluyen ácido azul 147, xileno cianol, xileno cianol ff, xileno cianol ff, etc.

La fórmula química de este compuesto es c25H27norte2Nao6S2. La masa molar de xileno cianol es 538.61 g/mol. Esta sustancia puede migrar a una tasa de aproximadamente 4 a 5 kilobase de fragmentos de ADN en geles de agarosa al 1%. Sin embargo, esto depende del búfer que usamos. Por lo general, el xileno cianol en gel de poliacrilamida al 6% puede migrar a una velocidad de aproximadamente 140 fragmentos de ADN de pares de bases. Por otro lado, puede migrar en electroforesis en gel de poliacrilamida desnaturalizante a una velocidad de 25 bases oligonucleótido.

El recuento de donantes de enlaces de hidrógeno de xileno cianol es de 2 m, y el recuento de aceptores de enlace de hidrógeno es 8. El recuento de enlaces rotativos de este compuesto se puede administrar como 7. La complejidad del xileno cianol puede describirse como 1120 grados. Tiene un recuento de estereocentro de enlace definido de 1.

¿Qué es el azul de bromofenol??

El azul de bromofenol es un indicador de pH útil que es útil como marcador de color electroforético y un tinte. Tiene el nombre químico 3 ', 3 ", 5', 5" -Tetrabromofenolsulfonphtalein, BPB. La fórmula química de este compuesto es c19H10BR4O5S. La masa molar de este compuesto es 669.96 g/mol. Es inodoro, y su densidad se puede dar como 2.2 g/ml. Su punto de fusión es 273 grados Celsius, y su punto de ebullición es 279 grados Celsius. Podemos prepararlo agregando lentamente un exceso de bromo a una solución caliente de fenolsulfonftaleína en ácido acético glacial.

El azul de bromofenol es útil como indicador de base ácida en el rango entre el pH 3.0 a 4.6. Es capaz de cambiar de amarillo a pH 3.0 al ph 4.6. Además, es una reacción reversible. Estructuralmente, el azul de bromofenol es similar a la fenolftaleína.

Además, podemos usarlo como marcador de color para monitorear el proceso de electroforesis en gel de agarosa y electroforesis en gel de poliacrilamida. Esta sustancia puede transportar una carga negativa a un pH moderado, donde puede migrar en la misma dirección que el ADN o la proteína en un gel. La tasa de migración puede variar según la densidad del gel y la composición del tampón. Sin embargo, en un gel de agarosa al 1% típico en 1 tampón TAE o tampón TBE, esta sustancia migra a la misma velocidad que un fragmento de ADN de aproximadamente 300 pares de bases.

¿Cuál es la diferencia entre el xileno cianol y el azul de bromofenol??

Xileno cianol y azul de bromofenol son marcadores de color importantes. La diferencia clave entre el xileno cianol y el azul de bromofenol es que en el gel de agarosa al 1%, el xileno cianol migra más lento, mientras que el azul de bromofenol migra más rápido.

A continuación se muestra un resumen de la diferencia entre el xileno cianol y el azul de bromofenol en forma tabular para la comparación de lado a lado.

Resumen -xileno cianol vs bromofenol azul

Xileno cianol y azul de bromofenol son importantes ya que los marcadores de color utilizados para monitorear el proceso de electroforesis en gel de agarosa y electroforesis en gel de poliacrilamida. La diferencia clave entre el xileno cianol y el azul de bromofenol es que en el gel de agarosa al 1%, el xileno cianol migra más lento, mientras que el azul de bromofenol migra más rápido.

Referencia:

1. "Xylen Cyanol FF." Centro Nacional de Información de Biotecnología. Base de datos compuesto de pubchem, U.S. Biblioteca Nacional de Medicina.

Imagen de cortesía:

1. "Xylencyanol" de Kopiersperre - Trabajo propio (dominio público) a través de Commons Wikimedia
2. "Bromophenol Blue" de Panoramix303 - Trabajo propio (dominio público) a través de Commons Wikimedia